103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6833 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  37.07 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  40.57 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  41.05 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  38.26 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  37.89 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  36.79 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  37.04 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  39.62 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  38.95 
 
 		 541 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  35.85 
 
 		 548 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  34.26 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  33.96 
 
 		 548 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  34.58 
 
 		 319 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  35.19 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  28.32 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  34.86 
 
 		 321 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  32.41 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  33.02 
 
 		 550 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  33.02 
 
 		 550 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  38.89 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  37.14 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1027  hypothetical protein  38.14 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  34.26 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  42.53 
 
 		 311 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  30.36 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  32.08 
 
 		 550 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  35.25 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  33.02 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  37 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  31.37 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  35.71 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  35.71 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  35.71 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  35 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  28.7 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  33.67 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  34.69 
 
 		 317 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  33.67 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  33.02 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  31.13 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  36.08 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  28.97 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  30.19 
 
 		 305 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  35.78 
 
 		 312 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  30.56 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  33.94 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  33.98 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  29.79 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  29.29 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  32 
 
 		 136 aa  50.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  34.55 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  32.41 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  27.78 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  32.29 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  26.85 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  31.07 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  35.79 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  40 
 
 		 333 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  33.01 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  30.56 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  32.58 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  33.91 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  34.74 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  32.58 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  28.97 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  28.42 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  33.68 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  30.63 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  38.57 
 
 		 322 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  30.28 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  34.74 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  27.03 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  30.56 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  30.69 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  35.96 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  28.3 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  26.89 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  28.04 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  35.92 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  32.95 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  29.25 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  32.08 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  30.21 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  31.25 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4310  protein of unknown function DUF35  44.44 
 
 		 119 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  30.63 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  26.26 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  29.25 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0597  protein of unknown function DUF35  37.68 
 
 		 490 aa  41.2  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  31.11 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  31.68 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  31.63 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  36.36 
 
 		 178 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  31.31 
 
 		 473 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  27.93 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  28.97 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  29.91 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>