98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6562 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  100 
 
 		 410 aa  835    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  60.05 
 
 		 444 aa  473  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  54.28 
 
 		 415 aa  433  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  56.53 
 
 		 427 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  51.36 
 
 		 409 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  54.84 
 
 		 410 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  54.71 
 
 		 410 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  45.23 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  43.35 
 
 		 420 aa  349  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  45.21 
 
 		 411 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  43.1 
 
 		 433 aa  346  5e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  45.91 
 
 		 416 aa  344  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  43.87 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  43.98 
 
 		 411 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  42.36 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  42.86 
 
 		 407 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  40.98 
 
 		 413 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  44.42 
 
 		 407 aa  330  4e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  40.73 
 
 		 413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  41.32 
 
 		 411 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  42.05 
 
 		 412 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  42.51 
 
 		 408 aa  319  7e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  44.03 
 
 		 409 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  41.48 
 
 		 420 aa  312  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  41.54 
 
 		 408 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  43.78 
 
 		 409 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  37.19 
 
 		 411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  43.31 
 
 		 413 aa  306  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  43.03 
 
 		 409 aa  305  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  40.39 
 
 		 407 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  39.95 
 
 		 413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  42.01 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  39.8 
 
 		 407 aa  301  9e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  39.41 
 
 		 406 aa  300  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  39.7 
 
 		 400 aa  295  9e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  38.33 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  40.59 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  38.33 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  40.56 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  38.33 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.35 
 
 		 421 aa  290  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  39.07 
 
 		 419 aa  289  8e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  41.13 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  40 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  37.91 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  42.86 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  36.98 
 
 		 402 aa  269  5e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  39.56 
 
 		 408 aa  266  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  38.02 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  38.26 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  31.07 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  32.77 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  32.77 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  28.07 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  26.54 
 
 		 409 aa  179  9e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  28.05 
 
 		 409 aa  173  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  25.42 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  25.78 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  25.78 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  26.61 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  24.49 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  24.17 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  25 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  35.77 
 
 		 178 aa  99  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  25.82 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  28.01 
 
 		 817 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  25.63 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  26.95 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  23.86 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  25.69 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  22.28 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  25.94 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  21.94 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  24.15 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  26.17 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  24.27 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  24.77 
 
 		 425 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  24 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  20.25 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  17.13 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  22.43 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  24.33 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  22.03 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  22.28 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  22.33 
 
 		 352 aa  53.1  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  23.73 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  21.59 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  23.08 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  23.08 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  26.28 
 
 		 306 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.26 
 
 		 310 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  25.79 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 210 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33332  predicted protein  18.83 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  18.49 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  21.69 
 
 		 300 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  22.57 
 
 		 305 aa  43.1  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  18.4 
 
 		 379 aa  42.7  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>