More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6352 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 442 aa  860    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0623  histidine kinase  51.13 
 
 		 403 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.33 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 496 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000683339  hitchhiker  0.000292513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  36.82 
 
 		 409 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0235  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  41.04 
 
 		 435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  35.62 
 
 		 384 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  41.59 
 
 		 426 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  36.57 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 394 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.02 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0261  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.37 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.653023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  37.79 
 
 		 399 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 394 aa  113  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  36.19 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  37.66 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  38.98 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  37.13 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 382 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  38.21 
 
 		 438 aa  110  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  42.66 
 
 		 372 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  38.53 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  31.35 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  35.38 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  39.8 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.46 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.47 
 
 		 438 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.31 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.71 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  30.74 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  35.63 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  36.71 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  33.67 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  31.02 
 
 		 478 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  34.8 
 
 		 420 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  33.61 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.24 
 
 		 370 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  36.36 
 
 		 393 aa  103  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  35.78 
 
 		 422 aa  103  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  36.36 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  32.95 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.65 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1620  histidine kinase  37.25 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25610  histidine kinase  37.32 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.309786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  34.3 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  37.62 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.93 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  36.82 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0184  regulatory protein LuxR  35.61 
 
 		 489 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  37.38 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3474  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.5 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  33.94 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  36.45 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  33.79 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4673  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.35 
 
 		 399 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.19 
 
 		 567 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  34.52 
 
 		 291 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  39.09 
 
 		 423 aa  99.8  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  38.16 
 
 		 372 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 469 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 601 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1821  histidine kinase  35.51 
 
 		 384 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  38.39 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  40.21 
 
 		 555 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  34.43 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  36.89 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  39.15 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  37.82 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 387 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 437 aa  97.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  35.27 
 
 		 357 aa  97.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  32.58 
 
 		 430 aa  97.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 392 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.25 
 
 		 401 aa  96.7  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  35.21 
 
 		 382 aa  96.7  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 386 aa  96.7  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.46 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0292279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  34.27 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  34.95 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>