277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4292 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  100 
 
 		 402 aa  796    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  75.68 
 
 		 403 aa  623  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  76.12 
 
 		 408 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  76.12 
 
 		 408 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  76.12 
 
 		 408 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  74.26 
 
 		 404 aa  608  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  73.45 
 
 		 412 aa  592  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  71.46 
 
 		 411 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  62.62 
 
 		 419 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  59.75 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  59.1 
 
 		 402 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  59.26 
 
 		 414 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  60.55 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  59.45 
 
 		 424 aa  454  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  60.55 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  60 
 
 		 421 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  60.55 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  43.98 
 
 		 430 aa  296  5e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  43.86 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  41.99 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  40 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  39.56 
 
 		 431 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  40.2 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  41.15 
 
 		 440 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  41.34 
 
 		 426 aa  259  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  40.1 
 
 		 423 aa  255  9e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  42.06 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  40.38 
 
 		 444 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  40.29 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  41.03 
 
 		 459 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  41.33 
 
 		 455 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  40.32 
 
 		 437 aa  233  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  40.62 
 
 		 438 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  36.92 
 
 		 426 aa  229  4e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  39.79 
 
 		 433 aa  229  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  41.22 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  38.35 
 
 		 444 aa  226  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  40.31 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  37.86 
 
 		 422 aa  222  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  44.05 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  36.46 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  38.39 
 
 		 426 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  36.3 
 
 		 428 aa  212  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  36.32 
 
 		 407 aa  209  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  38.92 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  37.4 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  36.29 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  35.8 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  39.13 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  33.97 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  37.38 
 
 		 480 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  33.01 
 
 		 401 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  36.84 
 
 		 421 aa  196  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  36.47 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  34.77 
 
 		 432 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  34.69 
 
 		 423 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  33.5 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  32.44 
 
 		 400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  31.9 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  32.69 
 
 		 431 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  36.73 
 
 		 425 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  35.34 
 
 		 416 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  35.03 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  32.85 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  33.59 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  33.42 
 
 		 407 aa  173  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  35.07 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  33.93 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  35.01 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  34.53 
 
 		 419 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  33.74 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  32.13 
 
 		 413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  33.08 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  33.07 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  33.33 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  38.8 
 
 		 408 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  31.53 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  33.58 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  35.81 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  31.53 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  35.81 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  35.81 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  34.62 
 
 		 412 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  32.98 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  33.73 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  34.52 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  32.57 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  29.85 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  31.9 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  35.57 
 
 		 426 aa  153  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  30.83 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  33.01 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  31.69 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  33.49 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  31.76 
 
 		 478 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  29.43 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  31.84 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  32 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  30.15 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  30.18 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>