More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1428 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  100 
 
 
405 aa  809    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  46.88 
 
 
429 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  49.37 
 
 
416 aa  360  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  45.91 
 
 
417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  47.34 
 
 
423 aa  354  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  46.79 
 
 
414 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  42.5 
 
 
427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  43.73 
 
 
410 aa  279  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  41.65 
 
 
402 aa  276  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.24 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  39.14 
 
 
398 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  38.14 
 
 
405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.55 
 
 
411 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  38.24 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  34.38 
 
 
420 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  43.03 
 
 
417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.3 
 
 
412 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  35.52 
 
 
411 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  34.56 
 
 
412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  35.06 
 
 
412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  41.3 
 
 
407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  36.41 
 
 
414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  36.27 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.78 
 
 
412 aa  233  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  33.42 
 
 
411 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  39.85 
 
 
404 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  35.32 
 
 
402 aa  229  5e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  36.59 
 
 
436 aa  229  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  39.81 
 
 
410 aa  229  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  45.68 
 
 
459 aa  229  9e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  36.79 
 
 
399 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  33.33 
 
 
411 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  40.4 
 
 
423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  32.41 
 
 
411 aa  226  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  36.02 
 
 
399 aa  225  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.73 
 
 
426 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  34.83 
 
 
402 aa  225  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  39.85 
 
 
409 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.9 
 
 
411 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.82 
 
 
411 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  35.24 
 
 
408 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  35.01 
 
 
400 aa  223  6e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  33.7 
 
 
411 aa  222  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  33.7 
 
 
411 aa  222  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  33.42 
 
 
411 aa  222  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  33.42 
 
 
411 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  33.42 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  36.52 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  35.01 
 
 
399 aa  220  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  34.94 
 
 
380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  35.89 
 
 
417 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  36 
 
 
392 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  37.18 
 
 
417 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  35.08 
 
 
410 aa  219  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  36.52 
 
 
402 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.66 
 
 
411 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  34.86 
 
 
442 aa  215  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  35.1 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  34.01 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  36.83 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  37.6 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  35.15 
 
 
421 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  33.91 
 
 
407 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  34.38 
 
 
406 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  33.91 
 
 
407 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  33.17 
 
 
405 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  33.91 
 
 
407 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.57 
 
 
411 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.86 
 
 
394 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  34.86 
 
 
418 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  37.44 
 
 
450 aa  211  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  34.78 
 
 
408 aa  210  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.85 
 
 
388 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  35.75 
 
 
410 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  33.82 
 
 
401 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.43 
 
 
400 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  34.24 
 
 
406 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  31.34 
 
 
422 aa  206  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  34.9 
 
 
400 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  36.46 
 
 
395 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  32.52 
 
 
403 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  33.59 
 
 
404 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  33.33 
 
 
409 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  37.96 
 
 
398 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  33.83 
 
 
417 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  40.72 
 
 
421 aa  203  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  35.35 
 
 
422 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  39.42 
 
 
423 aa  202  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  34.52 
 
 
399 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  34.62 
 
 
429 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  32.63 
 
 
419 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  35.25 
 
 
409 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  33.58 
 
 
417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  36.36 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  36.36 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  35.73 
 
 
464 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  32.07 
 
 
413 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  36.66 
 
 
435 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  33.65 
 
 
405 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  38.3 
 
 
447 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>