224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0409 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 334 aa  654    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 316 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  42.12 
 
 		 316 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  41.67 
 
 		 316 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  40.2 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2643  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000047791  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3422  transcriptional regulator, DeoR family  41.77 
 
 		 331 aa  222  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00167672  hitchhiker  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  38.02 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  38.02 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3426  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  39.55 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  30.79 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  31.63 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.63 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  31.63 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  31.63 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.63 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.63 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  31.31 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.99 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.67 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 317 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  28.08 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  26.81 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  30.13 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  26.2 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 326 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  27.33 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  33.44 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  30.03 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  29.04 
 
 		 323 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  27.71 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  30.03 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  30.03 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  28.81 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2553  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2598  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0969479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2592  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0641807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  28.81 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2088  transcriptional regulator, DeoR family  35.44 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3725  transcriptional regulator, DeoR family  27.01 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000852212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  28.67 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  28.81 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  28.81 
 
 		 315 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  29.14 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  28.81 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  33.77 
 
 		 694 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  28.81 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  30.65 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  30.28 
 
 		 325 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  30.84 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  33.44 
 
 		 694 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  33.11 
 
 		 695 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  31.99 
 
 		 700 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  29.13 
 
 		 333 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 333 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 320 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  30.7 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 336 aa  106  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  23.84 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0522  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29850  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  28.48 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  30.45 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2790  DeoR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2834  DeoR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2817  DeoR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0275474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1869  transcriptional regulator, DeoR family  28.98 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  30.45 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  30.45 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3997  transcriptional regulator, DeoR family  30.75 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  30.45 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  30.1 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3263  DeoR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  29.58 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2797  transcriptional regulator, DeoR family  29.49 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  31.33 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0701  transcriptional regulator, putative  29.75 
 
 		 339 aa  99.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  29.32 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>