126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1840 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  66.67 
 
 		 280 aa  360  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  65.4 
 
 		 288 aa  357  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  65.27 
 
 		 279 aa  335  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  62.13 
 
 		 306 aa  321  9.000000000000001e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  65.67 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  53.98 
 
 		 302 aa  290  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  51.65 
 
 		 277 aa  281  7.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  48.58 
 
 		 279 aa  276  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  64.98 
 
 		 215 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  52.65 
 
 		 279 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  71.27 
 
 		 182 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  48.55 
 
 		 293 aa  258  9e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  51.5 
 
 		 273 aa  255  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  51.14 
 
 		 268 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  46.77 
 
 		 288 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  47.78 
 
 		 268 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  49.47 
 
 		 277 aa  244  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  48.08 
 
 		 266 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  47.57 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  47.89 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  47.37 
 
 		 272 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  44.89 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  48.85 
 
 		 270 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  47.81 
 
 		 268 aa  234  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  49.06 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  49.03 
 
 		 267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  46.93 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  48.46 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  46.84 
 
 		 266 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  46.62 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  49.03 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  50.94 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  45.45 
 
 		 268 aa  225  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  48.16 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  45.77 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  43.73 
 
 		 277 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  43.17 
 
 		 274 aa  218  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  47.31 
 
 		 263 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  47.15 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  48.13 
 
 		 265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  45.86 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  45.21 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  47.57 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  45.59 
 
 		 269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  47.67 
 
 		 271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  46.67 
 
 		 279 aa  211  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  46.39 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  46.04 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  42.01 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  44.98 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  43.61 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  51.05 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  45.39 
 
 		 267 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  47.27 
 
 		 280 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  47.52 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  44.44 
 
 		 267 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  41.89 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  44.83 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  42.46 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  45 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  45.31 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  41.29 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  46.78 
 
 		 263 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  48.12 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  45.95 
 
 		 266 aa  198  9e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  46.41 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  42.64 
 
 		 275 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  47.23 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  48.26 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  40.29 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  43.88 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  40.96 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  47.3 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  45.7 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  44.07 
 
 		 328 aa  192  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  43.7 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  43.94 
 
 		 267 aa  191  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  40.82 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0574  hypothetical protein  57.93 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  40.66 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  44.7 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  41.31 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  41.38 
 
 		 278 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33090  Protein of unknown function (DUF574)  39.49 
 
 		 278 aa  185  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  44.35 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  42.92 
 
 		 277 aa  181  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  40.78 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3639  hypothetical protein  56.44 
 
 		 169 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  39.27 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  40.98 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  41.57 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  43.46 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  38.2 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  39.39 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2723  hypothetical protein  66.39 
 
 		 144 aa  169  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.979081 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4030  hypothetical protein  54.88 
 
 		 173 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3635  hypothetical protein  71.57 
 
 		 133 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1307  protein of unknown function DUF574  38.46 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0163333  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  41.76 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>