123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0564 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  74.17 
 
 		 151 aa  229  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  52.74 
 
 		 145 aa  156  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  55.41 
 
 		 148 aa  156  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  54.05 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  49.66 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  50.68 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  45.95 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  47.26 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  47.26 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  50.68 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  45.14 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  43.84 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  49.09 
 
 		 167 aa  113  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  43.36 
 
 		 165 aa  113  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  43.75 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  43.92 
 
 		 180 aa  111  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  38.31 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  43.84 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  36.94 
 
 		 160 aa  99.4  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  39.19 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  38.62 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  40.15 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  39.16 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  39.58 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  34.9 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  39.68 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  38.89 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  38.89 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  43.44 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  43.44 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  36.15 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  42.62 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  36.43 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  35.38 
 
 		 343 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  39.64 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  41.03 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  33.93 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  33.93 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  33.93 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6365  hypothetical protein  32.88 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  32.45 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  34.85 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  34.58 
 
 		 182 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  35.83 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  35.83 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  35.83 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  33.04 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  36.05 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  30.82 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  31.21 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  40 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  37.5 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  32.58 
 
 		 339 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  27.21 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31.51 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31.51 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5121  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  27.59 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  31.67 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  29.73 
 
 		 335 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10648  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  26.61 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.039671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  35.2 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  32.87 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31.51 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  31.94 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0918  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  28.57 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0669251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0935  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  28.57 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  37.36 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  28.77 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1232  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  29.45 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  30.94 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2687  hypothetical protein  33.54 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0946  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  26.45 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5119  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.14 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  39 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  39 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  39 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  30.56 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2780  hypothetical protein  32.91 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.189937  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  29.25 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3229  hypothetical protein  32.97 
 
 		 382 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1230  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA  26.21 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  32.8 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  38.26 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  44.93 
 
 		 324 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2873  hypothetical protein  32.28 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  45.9 
 
 		 317 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4532  hypothetical protein  27.94 
 
 		 393 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  43.33 
 
 		 333 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  50 
 
 		 318 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  50 
 
 		 318 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  36.45 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  43.48 
 
 		 317 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  48.21 
 
 		 312 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  48.28 
 
 		 311 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>