More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1543 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2503  chaperonin GroEL  62.08 
 
 		 549 aa  656    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  61.74 
 
 		 544 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  62.17 
 
 		 547 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  62.45 
 
 		 544 aa  665    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  61.36 
 
 		 547 aa  649    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  61.94 
 
 		 536 aa  670    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0488  chaperonin GroEL  62.22 
 
 		 546 aa  640    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00790388  normal  0.0259613 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  60.82 
 
 		 545 aa  642    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  61.75 
 
 		 540 aa  650    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0860  chaperonin GroEL  60.78 
 
 		 543 aa  642    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  64.06 
 
 		 544 aa  679    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  64.25 
 
 		 544 aa  680    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  64.25 
 
 		 544 aa  680    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1234  chaperonin GroEL  60.82 
 
 		 545 aa  642    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  61.08 
 
 		 549 aa  657    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  61.96 
 
 		 541 aa  647    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0667  chaperonin GroEL  61.9 
 
 		 544 aa  657    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  59.77 
 
 		 547 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  86.96 
 
 		 538 aa  931    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  60.82 
 
 		 542 aa  651    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  61.29 
 
 		 545 aa  648    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  59.47 
 
 		 548 aa  635    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  100 
 
 		 538 aa  1064    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1055  chaperonin GroEL  59.12 
 
 		 545 aa  641    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  65.01 
 
 		 547 aa  653    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  64.25 
 
 		 544 aa  680    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  63.2 
 
 		 543 aa  658    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  62.31 
 
 		 540 aa  648    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  61.63 
 
 		 546 aa  650    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  61.91 
 
 		 548 aa  646    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  64.06 
 
 		 544 aa  679    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  60.45 
 
 		 542 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  65.53 
 
 		 541 aa  687    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 548 aa  652    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0586  chaperonin GroEL  64.29 
 
 		 544 aa  671    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1472  chaperonin GroEL  60.79 
 
 		 547 aa  638    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0166914  normal  0.319334 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  65.98 
 
 		 539 aa  686    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  62.5 
 
 		 536 aa  660    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  65.73 
 
 		 542 aa  681    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  62.43 
 
 		 540 aa  655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  61.81 
 
 		 547 aa  646    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  62.17 
 
 		 547 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  62.62 
 
 		 540 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  62.13 
 
 		 540 aa  643    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1420  chaperonin GroEL  59.51 
 
 		 549 aa  641    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.038504  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  61.01 
 
 		 545 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0308  chaperonin GroEL  61.57 
 
 		 544 aa  657    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0755477  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1908  chaperonin GroEL  59.47 
 
 		 552 aa  636    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  61.23 
 
 		 541 aa  649    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  60 
 
 		 544 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  64.06 
 
 		 544 aa  681    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3064  chaperonin GroEL  62 
 
 		 548 aa  650    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  64.25 
 
 		 544 aa  680    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  67.35 
 
 		 541 aa  710    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0287  chaperonin GroEL  59.66 
 
 		 552 aa  637    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000393634  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  59.66 
 
 		 550 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 546 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  63.5 
 
 		 544 aa  678    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0804  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 542 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451933  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  61.37 
 
 		 553 aa  651    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  62.71 
 
 		 545 aa  667    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  86.96 
 
 		 538 aa  931    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  60.45 
 
 		 539 aa  635    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1771  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 545 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190882  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  62.29 
 
 		 541 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  63.47 
 
 		 540 aa  678    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  60.15 
 
 		 540 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  60.6 
 
 		 550 aa  657    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  61.75 
 
 		 542 aa  666    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2521  60 kDa chaperonin (protein Cpn60)  60.04 
 
 		 541 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  62.99 
 
 		 539 aa  668    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  63.4 
 
 		 539 aa  665    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  60.71 
 
 		 547 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5285  chaperonin GroEL  60.91 
 
 		 546 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.361226 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0568  chaperonin GroEL  61.71 
 
 		 543 aa  653    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000440547  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4264  chaperonin GroEL  61.01 
 
 		 543 aa  635    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154167  normal  0.0469061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  61.99 
 
 		 547 aa  651    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  62.62 
 
 		 546 aa  660    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  62.29 
 
 		 541 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  64.61 
 
 		 542 aa  684    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0271  chaperonin GroEL  61.55 
 
 		 547 aa  646    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  62.36 
 
 		 545 aa  637    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  60.26 
 
 		 543 aa  639    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  61.55 
 
 		 547 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  65.93 
 
 		 538 aa  692    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  62.29 
 
 		 541 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0509  chaperonin GroEL  60.82 
 
 		 545 aa  643    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000331966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  63.58 
 
 		 543 aa  664    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  64.06 
 
 		 544 aa  682    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  63.01 
 
 		 544 aa  655    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  61.87 
 
 		 540 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  64.04 
 
 		 539 aa  665    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0363  chaperonin GroEL  60.23 
 
 		 541 aa  637    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.452598  normal  0.411886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3659  chaperonin GroEL  60.23 
 
 		 540 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  62.31 
 
 		 554 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  89.8 
 
 		 539 aa  958    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  64 
 
 		 544 aa  655    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1158  chaperonin GroEL  75.88 
 
 		 540 aa  792    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3646  chaperonin GroEL  61.13 
 
 		 541 aa  642    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  61.51 
 
 		 541 aa  642    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>