More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0090 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0090  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  475  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0840  ABC transporter related  69.1 
 
 		 231 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1754  ABC transporter related  59.57 
 
 		 237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1697  ABC transporter related  59.13 
 
 		 237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0594  ABC transporter related  51.9 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  48.77 
 
 		 262 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  48.77 
 
 		 262 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 249 aa  244  9e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  49.36 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  50.21 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  50.21 
 
 		 258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  50.21 
 
 		 258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  47.41 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  50.21 
 
 		 258 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  50.21 
 
 		 258 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  50.21 
 
 		 258 aa  241  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 262 aa  241  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 		 258 aa  241  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  49.59 
 
 		 260 aa  241  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  50.21 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  46.41 
 
 		 241 aa  240  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  48.31 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  50.21 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  47.41 
 
 		 241 aa  239  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  51.04 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  51.04 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  51.04 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  46.84 
 
 		 244 aa  238  4e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  49.17 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  51.04 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  51.04 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  51.04 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  51.04 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  47.68 
 
 		 244 aa  238  5e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  47.64 
 
 		 263 aa  238  8e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  47.01 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  48.7 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  48.15 
 
 		 263 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  44.68 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  45.83 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  48.31 
 
 		 254 aa  235  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  47.92 
 
 		 255 aa  235  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  47.72 
 
 		 266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  52.21 
 
 		 240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  45.11 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  45.96 
 
 		 240 aa  235  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  48.7 
 
 		 245 aa  234  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  49.57 
 
 		 247 aa  234  7e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  46 
 
 		 264 aa  234  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  47.66 
 
 		 268 aa  234  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  46.78 
 
 		 282 aa  234  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  46.58 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.61 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  46.46 
 
 		 321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  45.57 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  48.09 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  48.07 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  48.68 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  46.61 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  46.61 
 
 		 258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4389  ABC transporter-like protein protein  47.26 
 
 		 242 aa  232  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  46.84 
 
 		 244 aa  231  6e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  47.26 
 
 		 241 aa  231  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  46.19 
 
 		 241 aa  231  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  46.38 
 
 		 240 aa  231  7.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1638  ABC transporter-like  47.26 
 
 		 242 aa  231  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0878817  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  46.35 
 
 		 261 aa  231  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 		 254 aa  231  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 		 277 aa  230  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  45.96 
 
 		 241 aa  230  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  48.89 
 
 		 249 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  47.26 
 
 		 241 aa  230  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  45.64 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2580  ABC transporter-like protein  46.09 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  47.39 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  45.64 
 
 		 268 aa  229  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  44.73 
 
 		 311 aa  229  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0828  ABC transporter related  47.81 
 
 		 239 aa  229  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  46.96 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  43.7 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  46.32 
 
 		 244 aa  229  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  47.37 
 
 		 264 aa  228  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  44.73 
 
 		 247 aa  228  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  47.03 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  44.73 
 
 		 244 aa  228  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  46.89 
 
 		 262 aa  228  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  46.06 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  46.67 
 
 		 270 aa  228  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  49.78 
 
 		 253 aa  228  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  46.02 
 
 		 240 aa  228  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  46.52 
 
 		 251 aa  228  9e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2507  ABC transporter related  44.73 
 
 		 243 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  45.49 
 
 		 317 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  45.49 
 
 		 317 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  46.25 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  46.29 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  45.64 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>