More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4043 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
303 aa  629  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  39.93 
 
 
297 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  36.58 
 
 
301 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  38.89 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  38.6 
 
 
299 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  36.75 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  32.98 
 
 
300 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.24 
 
 
298 aa  176  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 
320 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  32.53 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  34.28 
 
 
300 aa  163  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  33.7 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  33.7 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  29.69 
 
 
312 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  34.77 
 
 
296 aa  157  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  32.99 
 
 
311 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  32.42 
 
 
308 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  33.89 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  30.31 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  28.72 
 
 
300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  32.03 
 
 
293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  32.86 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  30.69 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  33.96 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  28.21 
 
 
296 aa  122  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  29.66 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.38 
 
 
323 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.9 
 
 
298 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  29.19 
 
 
311 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  27.9 
 
 
294 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  29.02 
 
 
333 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  27.97 
 
 
329 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  26.43 
 
 
324 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  29.87 
 
 
307 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  27.53 
 
 
333 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.89 
 
 
306 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  27.09 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.21 
 
 
322 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.4 
 
 
323 aa  96.3  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  26.73 
 
 
307 aa  95.9  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  27.6 
 
 
309 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  27.27 
 
 
325 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  26.67 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  28.91 
 
 
316 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  25.71 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  28.76 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  26.97 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  25.16 
 
 
327 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  26.67 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17531  putative carbohydrate kinase  25.68 
 
 
338 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  25.62 
 
 
323 aa  89  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  26.07 
 
 
323 aa  89  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  26.33 
 
 
304 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  26.2 
 
 
315 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  28.78 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  27.95 
 
 
337 aa  85.5  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  25.57 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  27.72 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  26.62 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  24.69 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  25.52 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  26.98 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  24.5 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  26.69 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  28.63 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18191  putative carbohydrate kinase  26.99 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  26.67 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  28.3 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  22.19 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  29.26 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  27.34 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  25.48 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  26.09 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  26.58 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  24.64 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  24.68 
 
 
628 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  25.24 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1720  putative carbohydrate kinase  26.69 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.259189  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  28.3 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  26.69 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  25.59 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  24.29 
 
 
628 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  24.05 
 
 
670 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  23.68 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  25.1 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  25.96 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  23.48 
 
 
645 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18161  putative carbohydrate kinase  25.86 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.409365  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  24.09 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  25.89 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01731  putative carbohydrate kinase  23.84 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  24.28 
 
 
644 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  22.74 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  24.28 
 
 
644 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  24.59 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  26.87 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  24.3 
 
 
642 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  23.63 
 
 
633 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18371  putative carbohydrate kinase  26.09 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.455738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  24.65 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>