More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3836 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3836  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 
586 aa  1219    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742198  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.67 
 
 
551 aa  342  8e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0792937 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2390  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.64 
 
 
550 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.517187  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2858  pyruvate decarboxylase  32.57 
 
 
547 aa  289  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.96 
 
 
546 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2218  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.74 
 
 
552 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2156  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.56 
 
 
552 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0887  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.57 
 
 
557 aa  268  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1571  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.53 
 
 
545 aa  263  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1754  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  29.41 
 
 
572 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2507  putative indolepyruvate decarboxylase  29.04 
 
 
558 aa  246  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2279  indolepyruvate decarboxylase  29.29 
 
 
561 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2581  putative indolepyruvate decarboxylase  28.94 
 
 
558 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2232  indolepyruvate decarboxylase  28.75 
 
 
561 aa  242  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2311  indolepyruvate decarboxylase  28.9 
 
 
561 aa  241  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2486  indolepyruvate decarboxylase  28.9 
 
 
561 aa  241  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00246816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2517  indolepyruvate decarboxylase, putative  28.87 
 
 
561 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000921209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2440  putative indolepyruvate decarboxylase  26.85 
 
 
558 aa  230  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00745629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.81 
 
 
546 aa  230  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0173  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.81 
 
 
546 aa  230  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2242  indole-3-pyruvate decarboxylase  28.42 
 
 
549 aa  229  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2923  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.09 
 
 
552 aa  225  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.356965  normal  0.0604993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3412  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.5 
 
 
553 aa  224  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2548  indole-3-pyruvate decarboxylase  28.2 
 
 
550 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2663  indole-3-pyruvate decarboxylase  28.02 
 
 
550 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.603651 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2597  indole-3-pyruvate decarboxylase  28.02 
 
 
550 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.380997  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0996  thiamine pyrophosphate enzyme family decarboxylase  29.62 
 
 
549 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.604603  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0109  putative pyruvate decarboxylase  27.92 
 
 
580 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731177  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2639  indole-3-pyruvate decarboxylase  27.85 
 
 
550 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4114  thiamine pyrophosphate enzyme  26.69 
 
 
541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.178401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1429  indolepyruvate decarboxylase  26.86 
 
 
542 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0493266 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0858  putative pyruvate decarboxylase  29.7 
 
 
556 aa  211  4e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.434282  normal  0.563377 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2434  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.7 
 
 
572 aa  207  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118986  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0964  pyruvate decarboxylase  26.94 
 
 
556 aa  205  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.719154  unclonable  0.0000449891 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3426  indolepyruvate decarboxylase  27.07 
 
 
555 aa  203  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.310622  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2362  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.06 
 
 
553 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10870  pyruvate or indole-3-pyruvate decarboxylase pdc  27.13 
 
 
560 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0234089 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1162  hypothetical protein  27.26 
 
 
559 aa  195  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3389  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.92 
 
 
562 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.887563  normal  0.228354 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04888  Pyruvate decarboxylase (EC 4.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P87208]  25.67 
 
 
568 aa  194  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0997848  normal  0.116699 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1157  hypothetical protein  27.26 
 
 
559 aa  194  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6051  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.64 
 
 
393 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221657  normal  0.609485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1794  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.56 
 
 
547 aa  185  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  0.90828 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08396  pyruvate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00750)  26.21 
 
 
575 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86443  pyruvate decarboxylase  25.58 
 
 
570 aa  181  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2242  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.08 
 
 
558 aa  176  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.48 
 
 
558 aa  169  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0518  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  24.91 
 
 
540 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3526  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  26.54 
 
 
543 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0476584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0101  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  24.82 
 
 
542 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438272  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64926  pyruvate decarboxylase  24.84 
 
 
596 aa  166  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.99262  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0838  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.86 
 
 
576 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00172744  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4795  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.19 
 
 
554 aa  163  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.781269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0182  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.32 
 
 
561 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.217855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0512  indole-3-pyruvate decarboxylase  26.99 
 
 
545 aa  161  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2719  phenylpyruvate decarboxylase  25.82 
 
 
553 aa  156  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572163  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2425  indole-3-pyruvate decarboxylase  26.37 
 
 
543 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3027  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  26.98 
 
 
543 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.306897  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2331  putative phenylpyruvate decarboxylase  25 
 
 
555 aa  151  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00138899  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00950  pyruvate decarboxylase, putative  24.46 
 
 
713 aa  139  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0027  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  23.17 
 
 
572 aa  134  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  23.73 
 
 
620 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  20.66 
 
 
577 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  23.56 
 
 
568 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  22.94 
 
 
563 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1900  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.73 
 
 
568 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.72 
 
 
568 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2521  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  25.05 
 
 
547 aa  101  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.948829  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.41 
 
 
586 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  21.8 
 
 
581 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1710  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  22.43 
 
 
615 aa  100  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.53529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1906  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  22.38 
 
 
619 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365234  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10680  acetolactate synthase, large subunit  23.1 
 
 
626 aa  98.6  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.141846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1886  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  22.38 
 
 
619 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0490387  normal  0.105007 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1952  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  22.38 
 
 
619 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338885  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  21.57 
 
 
561 aa  97.4  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.98 
 
 
586 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.63 
 
 
569 aa  95.9  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3392  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  22.2 
 
 
585 aa  95.1  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2539  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  22.94 
 
 
633 aa  94.7  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0377208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  24.32 
 
 
546 aa  94.4  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0587  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  21.54 
 
 
531 aa  93.2  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0776726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  21.95 
 
 
599 aa  93.2  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.3 
 
 
555 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  23.27 
 
 
546 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  24.12 
 
 
546 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  24.12 
 
 
546 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  24.12 
 
 
546 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  23.44 
 
 
586 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.9 
 
 
570 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  23.27 
 
 
546 aa  92.8  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2279  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  23.5 
 
 
635 aa  91.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4459  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  21.12 
 
 
566 aa  92  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.325037  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.54 
 
 
535 aa  92  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  23.91 
 
 
546 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  21.31 
 
 
544 aa  91.3  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  23.91 
 
 
546 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  23.91 
 
 
546 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  23.91 
 
 
546 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  21.54 
 
 
554 aa  91.3  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>