98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0196 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  100 
 
 		 91 aa  169  9e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  43.9 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  44.74 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  41.56 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1851  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153363  hitchhiker  0.000963738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2297  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0819  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  40.24 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0424  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  40.51 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  49.3 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0847  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0389  30S ribosomal protein S20  37.35 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.17035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2301  ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  42.67 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  40.91 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4938  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0947  ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.351712 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  45.31 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  40.58 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0320  30S ribosomal protein S20  37.35 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  42.5 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  41.33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6841  ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1511  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  37.78 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  42.11 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  42.11 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 86 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1265  ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 87 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.15154e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  42.11 
 
 		 92 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  37.78 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  42.11 
 
 		 92 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  42.11 
 
 		 92 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  42.11 
 
 		 92 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  42.11 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5203  30S ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.614694  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0100  30S ribosomal protein S20  37.8 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  38.96 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  39.71 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  36.99 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  38.75 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  38.16 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  42.03 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  39.08 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0524  ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000452156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1384  ribosomal protein S20  34.67 
 
 		 100 aa  40  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>