More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0023 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  97.01 
 
 
402 aa  810  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  97.26 
 
 
402 aa  818  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  96.27 
 
 
402 aa  812  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.7458e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  96.52 
 
 
402 aa  810  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  97.12 
 
 
382 aa  773  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
402 aa  839  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  80.05 
 
 
402 aa  689  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  96.38 
 
 
387 aa  780  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  96.27 
 
 
402 aa  807  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  97.01 
 
 
402 aa  808  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.53507e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  97.12 
 
 
382 aa  773  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  97.01 
 
 
402 aa  810  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  96.52 
 
 
402 aa  812  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.24341e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  96.52 
 
 
402 aa  805  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  96.27 
 
 
402 aa  805  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  63.22 
 
 
400 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  58.78 
 
 
411 aa  514  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  60.99 
 
 
403 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  60.73 
 
 
406 aa  505  1e-142  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  60.05 
 
 
411 aa  506  1e-142  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  60.21 
 
 
403 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  59.75 
 
 
411 aa  501  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  60.47 
 
 
403 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  58.72 
 
 
413 aa  495  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  58.05 
 
 
411 aa  494  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  58.64 
 
 
411 aa  493  1e-138  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  63.54 
 
 
399 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  56.5 
 
 
431 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  58.17 
 
 
348 aa  425  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  55.92 
 
 
422 aa  425  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  58.17 
 
 
348 aa  425  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  57.59 
 
 
348 aa  422  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  46.51 
 
 
435 aa  359  6e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  42.86 
 
 
422 aa  352  7e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  45.69 
 
 
381 aa  346  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  45.43 
 
 
381 aa  345  9e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  45.79 
 
 
408 aa  337  2e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  45.3 
 
 
408 aa  335  8e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  57.96 
 
 
231 aa  280  4e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  2.94639e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  58.72 
 
 
219 aa  269  5e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  38.24 
 
 
397 aa  252  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  38.24 
 
 
397 aa  252  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  38.21 
 
 
417 aa  240  3e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  37.47 
 
 
416 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.53 
 
 
391 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  37.06 
 
 
415 aa  226  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  33.5 
 
 
395 aa  226  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.13 
 
 
396 aa  217  3e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  33.68 
 
 
390 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  35.59 
 
 
399 aa  213  4e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  35.56 
 
 
373 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.29 
 
 
398 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  33.92 
 
 
416 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  35.03 
 
 
373 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  35.28 
 
 
399 aa  209  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  35.28 
 
 
399 aa  209  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  34.57 
 
 
373 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  34.57 
 
 
372 aa  209  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  35.03 
 
 
373 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  33.42 
 
 
383 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.36 
 
 
401 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  34.03 
 
 
368 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  36.91 
 
 
393 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  36.91 
 
 
393 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.53 
 
 
396 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.31 
 
 
361 aa  206  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  35.19 
 
 
377 aa  205  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  36.27 
 
 
386 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  35.81 
 
 
398 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  35.81 
 
 
398 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  34.76 
 
 
372 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.46 
 
 
381 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  34.76 
 
 
372 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  34.76 
 
 
372 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  34.76 
 
 
373 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  9.26712e-09  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  34.76 
 
 
373 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  34.76 
 
 
373 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  35.92 
 
 
429 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  34.65 
 
 
410 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  33.76 
 
 
424 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  32.66 
 
 
402 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  35.81 
 
 
398 aa  202  7e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  32.18 
 
 
391 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  32.21 
 
 
370 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  32.18 
 
 
391 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  33.84 
 
 
383 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  34.41 
 
 
410 aa  200  4e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  32.63 
 
 
385 aa  200  4e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.94492e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  31.84 
 
 
391 aa  199  8e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  33.78 
 
 
383 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  34.83 
 
 
375 aa  198  1e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  31.69 
 
 
370 aa  198  1e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  33.59 
 
 
383 aa  198  1e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.5 
 
 
376 aa  199  1e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  32.8 
 
 
363 aa  198  1e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  7.25079e-08 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 
383 aa  198  1e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  36.22 
 
 
377 aa  197  4e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  33.59 
 
 
377 aa  196  4e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  33.51 
 
 
383 aa  196  5e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  33.01 
 
 
405 aa  196  5e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>