More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2022 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  97.51 
 
 
402 aa  816  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  95.87 
 
 
387 aa  772  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  97.26 
 
 
402 aa  813  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  80.3 
 
 
402 aa  691  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  97.51 
 
 
402 aa  816  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  97.01 
 
 
402 aa  810  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 
402 aa  841  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.53507e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  96.27 
 
 
402 aa  809  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.7458e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  97.01 
 
 
402 aa  813  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  97.38 
 
 
382 aa  774  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  97.01 
 
 
402 aa  808  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  97.01 
 
 
402 aa  812  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  97.38 
 
 
382 aa  774  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  97.01 
 
 
402 aa  813  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.24341e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  96.27 
 
 
402 aa  805  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  63.22 
 
 
400 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  58.54 
 
 
411 aa  514  1e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  59.81 
 
 
411 aa  508  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  60.99 
 
 
406 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  61.26 
 
 
403 aa  511  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  60.73 
 
 
403 aa  506  1e-142  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  60.47 
 
 
403 aa  506  1e-142  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  60.25 
 
 
411 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  59.12 
 
 
411 aa  497  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  57.8 
 
 
411 aa  494  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  58.72 
 
 
413 aa  494  1e-138  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  63.54 
 
 
399 aa  471  1e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  56.25 
 
 
431 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  56.17 
 
 
422 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  57.88 
 
 
348 aa  427  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  57.88 
 
 
348 aa  427  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  57.31 
 
 
348 aa  425  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  46.05 
 
 
435 aa  357  3e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  43.1 
 
 
422 aa  354  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  45.69 
 
 
381 aa  349  6e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  45.43 
 
 
381 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  46.53 
 
 
408 aa  344  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  46.04 
 
 
408 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  57.52 
 
 
231 aa  281  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  2.94639e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  58.26 
 
 
219 aa  273  5e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  39.33 
 
 
397 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  39.33 
 
 
397 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  38.96 
 
 
417 aa  249  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  38.18 
 
 
416 aa  244  2e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.53 
 
 
391 aa  234  2e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  33.76 
 
 
395 aa  232  8e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  38.64 
 
 
415 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.17 
 
 
396 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.34 
 
 
398 aa  226  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  34.19 
 
 
390 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  36.32 
 
 
399 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.58 
 
 
396 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  34.18 
 
 
383 aa  219  8e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.37 
 
 
401 aa  219  8e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  33.92 
 
 
416 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  36.07 
 
 
399 aa  216  6e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  36.07 
 
 
399 aa  216  6e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  34.55 
 
 
368 aa  214  2e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  35.19 
 
 
424 aa  214  2e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  35.44 
 
 
377 aa  214  2e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  36.99 
 
 
398 aa  214  2e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  36.99 
 
 
398 aa  214  2e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  35.56 
 
 
410 aa  213  4e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  35.29 
 
 
373 aa  213  5e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.97 
 
 
381 aa  212  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  35.03 
 
 
373 aa  212  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  34.35 
 
 
383 aa  212  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  34.57 
 
 
373 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  36.18 
 
 
429 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  34.57 
 
 
372 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  36.99 
 
 
398 aa  212  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  34.57 
 
 
373 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  37.14 
 
 
386 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  32.67 
 
 
391 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.31 
 
 
361 aa  209  9e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  34.76 
 
 
372 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  35 
 
 
410 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  32.66 
 
 
402 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  32.43 
 
 
391 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  36.66 
 
 
393 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  36.66 
 
 
393 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  34.31 
 
 
373 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  34.31 
 
 
373 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  34.31 
 
 
373 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  9.26712e-09  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  34.76 
 
 
372 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.01 
 
 
376 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  34.76 
 
 
372 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  32.89 
 
 
385 aa  206  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.94492e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  33.9 
 
 
405 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  32.34 
 
 
391 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  36.48 
 
 
377 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  35.32 
 
 
375 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  32.21 
 
 
370 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 
383 aa  203  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  34.09 
 
 
377 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  33.92 
 
 
429 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  32.41 
 
 
409 aa  201  1e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  33.08 
 
 
383 aa  202  1e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  33.78 
 
 
383 aa  201  2e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  31.69 
 
 
370 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>