More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3658 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04206  multidrug efflux system protein  100 
 
 		 410 aa  814    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.652544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3658  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 410 aa  814    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4774  multidrug resistance protein MdtM  86.03 
 
 		 413 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.158436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4884  multidrug resistance protein MdtM  97.8 
 
 		 410 aa  798    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4872  multidrug resistance protein MdtM  86.03 
 
 		 413 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.891982 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3725  major facilitator transporter  93.6 
 
 		 408 aa  762    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4767  multidrug resistance protein MdtM  98.05 
 
 		 410 aa  800    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5851  multidrug resistance protein MdtM  98.05 
 
 		 410 aa  801    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.720836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04169  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  814    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.596573  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4920  multidrug resistance protein MdtM  86.03 
 
 		 413 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.998541  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4939  multidrug resistance protein MdtM  97.32 
 
 		 410 aa  796    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4848  multidrug resistance protein MdtM  86.03 
 
 		 413 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4565  multidrug resistance protein MdtM  97.56 
 
 		 410 aa  798    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4922  multidrug resistance protein MdtM  86.03 
 
 		 413 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.353329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4110  multidrug translocase MdfA  43.24 
 
 		 409 aa  329  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0048  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 409 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0092  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 415 aa  323  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3760  multidrug translocase  42.51 
 
 		 386 aa  319  5e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0869  multidrug translocase MdfA  41.76 
 
 		 410 aa  315  8e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2800  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 410 aa  315  9e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0904  multidrug translocase MdfA  41.49 
 
 		 410 aa  315  9e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248877  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00809  multidrug efflux system protein  41.49 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2800  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00826  hypothetical protein  41.49 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0995  multidrug translocase MdfA  41.49 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.0714029 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0914  multidrug translocase MdfA  41.49 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1334  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 411 aa  310  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0970  multidrug resistance protein MdtM  41.8 
 
 		 410 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1018  multidrug resistance protein MdtM  41.8 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.283578  normal  0.445773 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0902  multidrug resistance protein MdtM  41.8 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0938  multidrug resistance protein MdtM  41.8 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0999  multidrug resistance protein MdtM  41.8 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4495  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 414 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4370  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 413 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1354  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00928923  normal  0.137177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0961  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 414 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1360  hypothetical protein  34.92 
 
 		 426 aa  213  7e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1356  hypothetical protein  35.84 
 
 		 426 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2560  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.64 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  22.91 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  26.24 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.11 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.51 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.46 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.39 
 
 		 401 aa  104  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.76 
 
 		 444 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.07 
 
 		 413 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.53 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.53 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.78 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1767  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.27 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.37 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.29 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.25 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2999  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.05 
 
 		 408 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.0320436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.72 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  25.84 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.92 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.41 
 
 		 393 aa  97.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  25.84 
 
 		 392 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.05 
 
 		 405 aa  96.7  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  24.76 
 
 		 403 aa  96.3  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.91 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  27.19 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.63 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  25 
 
 		 398 aa  95.5  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.8 
 
 		 411 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2665  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.59 
 
 		 408 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126331  hitchhiker  0.00560959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.38 
 
 		 465 aa  93.6  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.38 
 
 		 428 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.03 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.15 
 
 		 498 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.76 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2460  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.35 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.154885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2193  inner membrane transport protein YdhC  29.39 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.230534  hitchhiker  0.00000667038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.62 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.35 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  27.5 
 
 		 394 aa  91.3  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.03 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.32 
 
 		 409 aa  90.5  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2043  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.03 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.678536  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1935  MFS permease  29.17 
 
 		 401 aa  90.5  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1629  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.82 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1912  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.06 
 
 		 408 aa  90.1  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758085  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.3 
 
 		 399 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  25.19 
 
 		 426 aa  89.7  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  26.87 
 
 		 396 aa  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01631  predicted transporter  27.35 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1969  inner membrane transport protein YdhC  27.35 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  27.3 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2373  inner membrane transport protein YdhC  27.35 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00231291  normal  0.112493 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  27.35 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.32 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.83 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.3 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.3 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  27.3 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>