182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2322 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1281  FAD dependent oxidoreductase  72.15 
 
 
464 aa  711    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.133559  normal  0.330956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3119  hypothetical protein  83.41 
 
 
463 aa  815    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000253637  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2322  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
462 aa  950    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2634  FAD dependent oxidoreductase  87.12 
 
 
463 aa  839    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0865  FAD dependent oxidoreductase  70.7 
 
 
461 aa  676    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969698  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0535  FAD dependent oxidoreductase  45.26 
 
 
483 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0222553  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1600  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.37 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00906255  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2846  hypothetical protein  43.64 
 
 
479 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0410024  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0312  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.97 
 
 
483 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.82561 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1411  FAD dependent oxidoreductase  44.3 
 
 
454 aa  389  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.839277  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1221  HI0933 family protein  42.64 
 
 
469 aa  388  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.362725  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0018  FAD dependent oxidoreductase  43.6 
 
 
472 aa  386  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417531  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0164  FAD dependent oxidoreductase  42.08 
 
 
479 aa  383  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0014  FAD dependent oxidoreductase  41.16 
 
 
468 aa  378  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000216552  normal  0.0136445 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1195  FAD dependent oxidoreductase  42.39 
 
 
479 aa  369  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0145  FAD dependent oxidoreductase  41.74 
 
 
482 aa  370  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.1054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0127  FAD dependent oxidoreductase  42.11 
 
 
484 aa  366  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2355  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 
460 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000540757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2310  FAD dependent oxidoreductase  39.83 
 
 
466 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000884654  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02150  FAD dependent oxidoreductase  37.31 
 
 
462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.753086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.26 
 
 
469 aa  330  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1923  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
462 aa  329  6e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000227487  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0072  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
475 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525129  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0497  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 
460 aa  319  7e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000325665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0009  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 
460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1879  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 
479 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000394734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2133  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 
464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2408  FAD dependent oxidoreductase  36.88 
 
 
479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2210  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 
458 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.626184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1155  hypothetical protein  36.5 
 
 
477 aa  307  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000301579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0425  hypothetical protein  35.85 
 
 
477 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000428075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3453  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 
469 aa  300  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000293029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1403  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 
466 aa  299  9e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000635691  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07360  FAD-dependent dehydrogenase  35.99 
 
 
468 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1583  glucose-inhibited division protein A  34.45 
 
 
477 aa  289  9e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000827555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0605  glucose-inhibited division protein A  34.1 
 
 
480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1429  FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 
467 aa  283  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.174684  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 
471 aa  282  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07290  FAD-dependent dehydrogenase  32.9 
 
 
467 aa  280  3e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0321  hypothetical protein  33.55 
 
 
457 aa  278  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000214801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2848  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
426 aa  212  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0135  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 
394 aa  190  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3534  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 
445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3775  hypothetical protein  27.09 
 
 
445 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000221813 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3607  hypothetical protein  27.09 
 
 
445 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00897123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3504  hypothetical protein  27.09 
 
 
445 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3894  hypothetical protein  27.09 
 
 
445 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0118999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3863  hypothetical protein  26.58 
 
 
445 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1435  hypothetical protein  26.27 
 
 
445 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0046977  hitchhiker  0.00538685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0582  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  32.43 
 
 
433 aa  167  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00687647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3516  hypothetical protein  26.87 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3796  hypothetical protein  26.43 
 
 
445 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00419795  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0336  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase-like protein  33.83 
 
 
447 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312335  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0318  hypothetical protein  33.83 
 
 
447 aa  160  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0384323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1810  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  28.36 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2604  oxidoreductase, FAD-binding  28.28 
 
 
548 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000157988  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1079  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0116  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 
530 aa  111  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0257  hypothetical protein  29.37 
 
 
270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 
513 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15935  predicted protein  29.34 
 
 
463 aa  108  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1077  hypothetical protein  26.21 
 
 
528 aa  107  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.216808  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12613  Uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  25.32 
 
 
518 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0800  hypothetical protein  27.96 
 
 
519 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1633  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
522 aa  103  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.108716  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3599  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 
524 aa  103  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2549  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 
527 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.04329e-17 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1164  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 
528 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1664  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 
527 aa  97.1  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7300  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 
520 aa  96.3  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1411  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  25.95 
 
 
534 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.142599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8970  DNA polymerase beta domain protein region  25.31 
 
 
732 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330578  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1018  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
570 aa  91.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.334562 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0945  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 
556 aa  90.9  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1203  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 
526 aa  90.9  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2641  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
542 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12190  FAD-dependent dehydrogenase  25.41 
 
 
610 aa  89.4  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0780318  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2101  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  23.94 
 
 
546 aa  89  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2930  hypothetical protein  25.94 
 
 
537 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.039165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1134  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
535 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0309936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2014  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenases  28.3 
 
 
530 aa  87.4  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.766468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3412  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 
535 aa  87  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4282  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
535 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289035  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15100  FAD-dependent dehydrogenase  26.75 
 
 
553 aa  86.7  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1023  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 
525 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.271687  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0869  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 
539 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.316187  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1152  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
535 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1169  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 
543 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2466  hypothetical protein  26.26 
 
 
515 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0591389  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1353  hypothetical protein  23.26 
 
 
535 aa  84.7  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1236  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 
537 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1017  putative uncharacterized dehydrogenase  24.43 
 
 
532 aa  84.3  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2339  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 
530 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.733661  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0864  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
546 aa  84  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 
519 aa  83.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1737  putative FAD-dependent dehydrogenase  26.2 
 
 
553 aa  83.6  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0998961  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0439  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 
532 aa  83.2  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0262472  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3016  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 
546 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.581254 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2427  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 
530 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28982  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2658  hypothetical protein  24.79 
 
 
533 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>