More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2351 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 620 aa  1217    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  71.65 
 
 		 440 aa  497  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  61.88 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  58.95 
 
 		 389 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  48.97 
 
 		 336 aa  310  5e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  48.1 
 
 		 339 aa  296  9e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  39.71 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  39.94 
 
 		 356 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  42.6 
 
 		 357 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  39.87 
 
 		 344 aa  217  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  43.07 
 
 		 329 aa  216  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  37.95 
 
 		 376 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  39.42 
 
 		 331 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  40.56 
 
 		 345 aa  204  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  38.05 
 
 		 332 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  40.7 
 
 		 333 aa  204  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  40.94 
 
 		 315 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  39.94 
 
 		 338 aa  200  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  40.46 
 
 		 336 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  41.69 
 
 		 328 aa  198  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  39.46 
 
 		 332 aa  197  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  40.8 
 
 		 377 aa  195  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  41.35 
 
 		 320 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  46.21 
 
 		 334 aa  193  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  44.87 
 
 		 337 aa  193  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  40.81 
 
 		 337 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  36.64 
 
 		 333 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  40.36 
 
 		 323 aa  191  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  40.69 
 
 		 325 aa  189  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  37.04 
 
 		 345 aa  188  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  37.03 
 
 		 327 aa  187  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  40.58 
 
 		 331 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  35.84 
 
 		 362 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  37.24 
 
 		 336 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  37.24 
 
 		 336 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  38.73 
 
 		 340 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  44.8 
 
 		 336 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  38.6 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  31.65 
 
 		 335 aa  182  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  36.39 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  37.46 
 
 		 340 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  38.66 
 
 		 332 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  38.37 
 
 		 327 aa  181  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  36.73 
 
 		 356 aa  181  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  35.61 
 
 		 335 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  36.84 
 
 		 345 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  36.84 
 
 		 345 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  36.84 
 
 		 345 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1947  aminodeoxychorismate lyase  38.53 
 
 		 335 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.817857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  36.84 
 
 		 345 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  40.92 
 
 		 331 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  40.54 
 
 		 333 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  43.6 
 
 		 336 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1922  aminodeoxychorismate lyase  37.35 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  36.58 
 
 		 349 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  39.02 
 
 		 339 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  35.45 
 
 		 337 aa  174  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  39.02 
 
 		 339 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  38.01 
 
 		 352 aa  173  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  32.94 
 
 		 343 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  36.69 
 
 		 349 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  37.79 
 
 		 345 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  34.86 
 
 		 331 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  36.53 
 
 		 341 aa  171  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  37.17 
 
 		 345 aa  171  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  38.11 
 
 		 345 aa  170  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  38.03 
 
 		 339 aa  170  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3387  putative lipoprotein  37.7 
 
 		 339 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1426  putative lipoprotein  37.7 
 
 		 339 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2444  hypothetical protein  37.7 
 
 		 339 aa  170  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1190  putative lipoprotein  37.7 
 
 		 339 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1917  hypothetical protein  37.7 
 
 		 339 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2321  putative lipoprotein  37.7 
 
 		 339 aa  170  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2282  putative lipoprotein  37.7 
 
 		 339 aa  170  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  35.05 
 
 		 357 aa  170  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  33.86 
 
 		 362 aa  170  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  38.03 
 
 		 339 aa  170  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  38.03 
 
 		 339 aa  170  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  34.58 
 
 		 355 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  34.49 
 
 		 338 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  38.49 
 
 		 339 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  35.96 
 
 		 328 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  38.03 
 
 		 339 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  38.03 
 
 		 324 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 348 aa  168  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  42.12 
 
 		 343 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  42.03 
 
 		 343 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  35.2 
 
 		 337 aa  166  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  41.36 
 
 		 343 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  34.37 
 
 		 358 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  36.18 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  32.37 
 
 		 338 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  38.3 
 
 		 339 aa  163  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  34.28 
 
 		 346 aa  163  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  33.65 
 
 		 337 aa  161  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2052  aminodeoxychorismate lyase  34.85 
 
 		 492 aa  161  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  34.21 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  37.61 
 
 		 336 aa  161  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  35.55 
 
 		 340 aa  160  6e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>