More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2198 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.68 
 
 
972 aa  731    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.08 
 
 
1086 aa  1268    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  61.18 
 
 
986 aa  928    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  69.76 
 
 
1053 aa  1142    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
1198 aa  2443    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.28 
 
 
959 aa  620  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.91 
 
 
962 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  37.82 
 
 
912 aa  545  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.66 
 
 
764 aa  526  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  37.41 
 
 
764 aa  525  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.25 
 
 
815 aa  519  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.79 
 
 
941 aa  496  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2984  helicase superfamily protein  37.91 
 
 
862 aa  480  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000404432  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.11 
 
 
815 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35840  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  39.01 
 
 
798 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0109244  normal  0.0530492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.15 
 
 
763 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.52 
 
 
973 aa  469  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4301  DEAD/DEAH box helicase-like  39.92 
 
 
804 aa  466  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2730  DEAD/DEAH box helicase-like  35.72 
 
 
751 aa  466  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0735  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.76 
 
 
790 aa  460  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773858  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26090  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  38.26 
 
 
833 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00586248  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.66 
 
 
804 aa  462  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  36.12 
 
 
797 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3155  Helicase superfamily 1 and 2 ATP-binding  36.69 
 
 
795 aa  459  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36643 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5321  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.9 
 
 
764 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13678  helicase  38.97 
 
 
771 aa  453  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00132558  normal  0.157688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4414  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.55 
 
 
824 aa  450  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18140  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  37.2 
 
 
865 aa  448  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.19 
 
 
768 aa  446  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.39 
 
 
762 aa  439  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  34.56 
 
 
795 aa  439  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2771  Protein of unknown function DUF1998  38.22 
 
 
866 aa  434  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00683804  hitchhiker  0.000025981 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.55 
 
 
861 aa  433  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.45 
 
 
753 aa  431  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0572  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.66 
 
 
775 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.65 
 
 
764 aa  425  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4799  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.87 
 
 
775 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0625  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.3 
 
 
803 aa  415  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4885  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.87 
 
 
775 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60576  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.03 
 
 
806 aa  415  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33220  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  34.03 
 
 
891 aa  412  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442514  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.14 
 
 
752 aa  412  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5399  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.68 
 
 
782 aa  412  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265021  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.77 
 
 
775 aa  413  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  33.53 
 
 
831 aa  399  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.46 
 
 
789 aa  396  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.62 
 
 
807 aa  387  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.21 
 
 
778 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0330  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.45 
 
 
868 aa  386  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.37 
 
 
829 aa  376  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0511  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.14 
 
 
739 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.814841  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  31.11 
 
 
815 aa  365  3e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.46 
 
 
773 aa  362  2e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.78 
 
 
764 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.58 
 
 
805 aa  356  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32 
 
 
803 aa  352  2e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0283  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.73 
 
 
807 aa  346  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926162  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0601  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.1 
 
 
848 aa  346  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502776  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  30.43 
 
 
1210 aa  340  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5571  Protein of unknown function DUF1998  39.5 
 
 
761 aa  340  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.96 
 
 
868 aa  335  4e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000944502  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4829  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.62 
 
 
807 aa  333  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.22 
 
 
855 aa  332  3e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  31.8 
 
 
758 aa  328  3e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0123  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.52 
 
 
761 aa  322  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0336832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.95 
 
 
781 aa  321  7e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036578  normal  0.532638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4033  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.95 
 
 
802 aa  310  9e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25230  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  36.6 
 
 
780 aa  308  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0220  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.31 
 
 
902 aa  305  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.72 
 
 
756 aa  300  9e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  29.79 
 
 
931 aa  288  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0673  NADPH-dependent FMN reductase  31.21 
 
 
738 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.91 
 
 
897 aa  283  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.21 
 
 
790 aa  282  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.46 
 
 
896 aa  278  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.450676  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.2 
 
 
751 aa  274  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2983  Protein of unknown function DUF1998  27.92 
 
 
948 aa  273  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  26.67 
 
 
905 aa  264  8.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.87 
 
 
758 aa  262  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.28 
 
 
739 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.47 
 
 
759 aa  240  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.44 
 
 
740 aa  240  1e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.53 
 
 
744 aa  234  1e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.75 
 
 
808 aa  232  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1976  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.27 
 
 
838 aa  224  9e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.54 
 
 
685 aa  217  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.82 
 
 
744 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.29 
 
 
744 aa  202  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.44 
 
 
744 aa  198  7e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.35 
 
 
751 aa  197  9e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5502  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.32 
 
 
914 aa  174  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.58 
 
 
911 aa  173  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0312  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.15 
 
 
879 aa  164  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.9 
 
 
815 aa  159  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.5 
 
 
766 aa  160  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.801207  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62134  predicted protein  25.93 
 
 
1178 aa  159  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.11 
 
 
812 aa  147  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1575  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.55 
 
 
187 aa  137  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2740  helicase domain-containing protein  41.85 
 
 
468 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  31.47 
 
 
1506 aa  129  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>