220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1524 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  47.62 
 
 
189 aa  188  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.92 
 
 
186 aa  169  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  38.86 
 
 
184 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  35.57 
 
 
216 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.98 
 
 
193 aa  141  8e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.5 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  30.11 
 
 
185 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
186 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  35.48 
 
 
186 aa  131  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.18 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.38 
 
 
192 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  30.61 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.26 
 
 
189 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.25 
 
 
195 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.53 
 
 
194 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.53 
 
 
190 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  30.65 
 
 
191 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.53 
 
 
190 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  34.52 
 
 
190 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.73 
 
 
190 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  31.84 
 
 
200 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.35 
 
 
186 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  32.97 
 
 
190 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  28.78 
 
 
165 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.34 
 
 
195 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  32.98 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  29.79 
 
 
188 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  28.88 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  28.49 
 
 
188 aa  89.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.93 
 
 
190 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  32.42 
 
 
195 aa  88.2  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  31.71 
 
 
189 aa  86.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  32.12 
 
 
189 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  29.88 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  28.88 
 
 
194 aa  79  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  31.03 
 
 
192 aa  79  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.12 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.49 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  33.05 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  33.33 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  35.07 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  28.12 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  28.12 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  32.48 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  33.09 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  35.77 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.36 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  25.67 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.62 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  29.77 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  29.09 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.89 
 
 
176 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.13 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  30.37 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  34.34 
 
 
185 aa  62.8  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  33.86 
 
 
177 aa  62.8  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.56 
 
 
159 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  36.36 
 
 
186 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  29.29 
 
 
188 aa  61.6  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.08 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  29.14 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.08 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  27.48 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  28.68 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  31.82 
 
 
197 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.68 
 
 
194 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  28.3 
 
 
189 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.5 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.01 
 
 
195 aa  58.5  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.55 
 
 
194 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  27.78 
 
 
184 aa  58.5  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  26.67 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  27.82 
 
 
182 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.37 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.73 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  31.69 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.23 
 
 
215 aa  56.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  25 
 
 
176 aa  56.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  26.71 
 
 
207 aa  55.5  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  26.27 
 
 
177 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.15 
 
 
215 aa  55.1  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  29.91 
 
 
185 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  28.36 
 
 
181 aa  54.7  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  29.77 
 
 
201 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  26.45 
 
 
152 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  31.54 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  32.09 
 
 
180 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.51 
 
 
155 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  30.71 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  29.77 
 
 
201 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  29.77 
 
 
201 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  31.36 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  25.52 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  31.36 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  31.36 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  28.46 
 
 
202 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.06 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>