More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0961 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  54.68 
 
 
710 aa  710    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  55.5 
 
 
675 aa  702    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
654 aa  1330    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  62.93 
 
 
690 aa  841    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.56 
 
 
644 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.39 
 
 
645 aa  552  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  41.01 
 
 
656 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  38.57 
 
 
657 aa  438  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  38.79 
 
 
657 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.16 
 
 
662 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.47 
 
 
654 aa  425  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.8 
 
 
657 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  38.57 
 
 
660 aa  416  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  38.75 
 
 
657 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  37.97 
 
 
586 aa  385  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  37.3 
 
 
582 aa  364  3e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.28 
 
 
703 aa  347  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.94 
 
 
588 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.19 
 
 
708 aa  329  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  36.75 
 
 
653 aa  325  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  34.77 
 
 
582 aa  321  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  36.74 
 
 
570 aa  320  5e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.99 
 
 
582 aa  320  6e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  34.99 
 
 
582 aa  320  7.999999999999999e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  34.57 
 
 
577 aa  317  4e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  36.1 
 
 
578 aa  316  7e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  38.14 
 
 
578 aa  313  5.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  34.92 
 
 
583 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  35.28 
 
 
613 aa  313  9e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  35.45 
 
 
613 aa  313  9e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  36.82 
 
 
607 aa  312  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  34.32 
 
 
578 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 
578 aa  311  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.75 
 
 
570 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  35.12 
 
 
578 aa  310  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  35.12 
 
 
578 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 
729 aa  310  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  37.35 
 
 
575 aa  307  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  34.62 
 
 
581 aa  308  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  33.52 
 
 
585 aa  308  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  33.95 
 
 
577 aa  307  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.77 
 
 
571 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 
580 aa  306  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  35.41 
 
 
580 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 
586 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 
582 aa  304  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  34.69 
 
 
583 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  34.44 
 
 
578 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  32.03 
 
 
695 aa  303  8.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  33.64 
 
 
614 aa  302  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  33.91 
 
 
622 aa  301  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  33.27 
 
 
580 aa  301  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  32.54 
 
 
631 aa  301  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  34.9 
 
 
548 aa  301  4e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  34.43 
 
 
552 aa  301  4e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  34.94 
 
 
587 aa  300  5e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  34.5 
 
 
583 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  34.5 
 
 
583 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  34.5 
 
 
583 aa  298  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  32.73 
 
 
597 aa  298  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  33.76 
 
 
553 aa  297  4e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  33.83 
 
 
584 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  33.83 
 
 
584 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.83 
 
 
584 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  33.83 
 
 
584 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  33.76 
 
 
553 aa  296  8e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  32.54 
 
 
713 aa  296  9e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 
590 aa  296  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  33.5 
 
 
708 aa  296  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  34.5 
 
 
583 aa  296  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 
727 aa  295  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.63 
 
 
582 aa  295  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  32.25 
 
 
601 aa  293  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  34.11 
 
 
615 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 
705 aa  292  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 
671 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 
615 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.64 
 
 
561 aa  291  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 
615 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0352  peptidoglycan synthetase FtsI  32.49 
 
 
599 aa  291  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  34.14 
 
 
590 aa  290  5.0000000000000004e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  35.84 
 
 
575 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 
670 aa  289  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  29.91 
 
 
719 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 
581 aa  289  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  32.7 
 
 
740 aa  289  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  35.32 
 
 
615 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  32.55 
 
 
588 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  36.76 
 
 
556 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  32.55 
 
 
588 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  32.55 
 
 
588 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  32.55 
 
 
588 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  32.55 
 
 
588 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.2 
 
 
619 aa  287  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  32.91 
 
 
588 aa  287  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  33.89 
 
 
616 aa  287  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  33.63 
 
 
579 aa  287  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 
582 aa  287  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 
615 aa  286  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  32.73 
 
 
588 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>