More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1401 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  100 
 
 
574 aa  1165    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  37.24 
 
 
639 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  35.73 
 
 
643 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  36.38 
 
 
586 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  35.84 
 
 
645 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  37.1 
 
 
642 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  35.37 
 
 
647 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.53 
 
 
671 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  33.95 
 
 
646 aa  365  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  35.65 
 
 
611 aa  363  4e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  33.98 
 
 
609 aa  363  6e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 
634 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  34.26 
 
 
597 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  35.8 
 
 
636 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  34.29 
 
 
645 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  34.36 
 
 
602 aa  353  4e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  36.23 
 
 
619 aa  352  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 
618 aa  350  5e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
631 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  34.88 
 
 
628 aa  348  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
678 aa  347  3e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  35.06 
 
 
610 aa  347  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  35.37 
 
 
588 aa  346  7e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  32.76 
 
 
602 aa  346  8e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  32.76 
 
 
602 aa  346  8e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  32.38 
 
 
629 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  32.36 
 
 
629 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  36.74 
 
 
557 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  34.23 
 
 
640 aa  343  7e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  32.53 
 
 
629 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  32.3 
 
 
629 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  34.23 
 
 
755 aa  342  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  35.27 
 
 
598 aa  342  1e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  34.15 
 
 
631 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 
627 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  33.62 
 
 
662 aa  340  4e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  34.65 
 
 
600 aa  340  4e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  33.98 
 
 
631 aa  340  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  36.57 
 
 
557 aa  339  7e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
681 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  36.35 
 
 
646 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 
664 aa  337  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 
630 aa  336  7e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  34.2 
 
 
630 aa  336  7e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  33.92 
 
 
646 aa  336  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  32.1 
 
 
632 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.83 
 
 
636 aa  334  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  34.09 
 
 
646 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  33.96 
 
 
640 aa  333  6e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  33.7 
 
 
596 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  32.6 
 
 
629 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  32.6 
 
 
629 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  33.11 
 
 
673 aa  331  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  32.77 
 
 
640 aa  331  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  32.82 
 
 
681 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  32.51 
 
 
793 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 
630 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  32.55 
 
 
630 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  35.64 
 
 
599 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  35.45 
 
 
669 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  33.28 
 
 
615 aa  325  9e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  33.28 
 
 
612 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  32.37 
 
 
648 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  32.73 
 
 
766 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  34.97 
 
 
641 aa  325  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  31.99 
 
 
630 aa  324  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  31.8 
 
 
646 aa  323  5e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  31.76 
 
 
635 aa  322  9.000000000000001e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  32.71 
 
 
667 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.61 
 
 
633 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  32.71 
 
 
631 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  32.81 
 
 
646 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  31.89 
 
 
801 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  33.06 
 
 
635 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  34.63 
 
 
619 aa  318  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  31.05 
 
 
716 aa  318  2e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000017381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  32.34 
 
 
771 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  32.05 
 
 
800 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  32.36 
 
 
655 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  33.05 
 
 
586 aa  315  9.999999999999999e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 
640 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  30.37 
 
 
628 aa  314  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  31.83 
 
 
613 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  33.86 
 
 
647 aa  313  6.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  31.39 
 
 
802 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  31.39 
 
 
802 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  31.39 
 
 
802 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  32.6 
 
 
637 aa  312  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  34.09 
 
 
595 aa  312  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  31.39 
 
 
802 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 
605 aa  311  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  31.79 
 
 
767 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  32.03 
 
 
647 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  31.17 
 
 
803 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  32.27 
 
 
648 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  32.27 
 
 
648 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  31.53 
 
 
643 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  34.09 
 
 
643 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  31.8 
 
 
640 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  31.17 
 
 
809 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>