More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3241 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  100 
 
 		 349 aa  693    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  64.41 
 
 		 348 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  59.83 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  62.9 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  61.92 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  63.08 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  54.65 
 
 		 357 aa  335  5.999999999999999e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  54.42 
 
 		 351 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  52.48 
 
 		 362 aa  324  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  52.57 
 
 		 352 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  49.86 
 
 		 354 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  49.86 
 
 		 354 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  50.86 
 
 		 367 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  49.71 
 
 		 340 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  51.14 
 
 		 352 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0983  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase lpcC  45.71 
 
 		 352 aa  282  6.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.327737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5673  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  46.38 
 
 		 348 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.108379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  37.75 
 
 		 362 aa  226  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  37.11 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  34.93 
 
 		 364 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  34.78 
 
 		 349 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 		 434 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 		 426 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 		 419 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  31.36 
 
 		 382 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.75 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 		 411 aa  99.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 434 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  36.97 
 
 		 413 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 		 448 aa  98.6  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  30.08 
 
 		 388 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  33.94 
 
 		 424 aa  97.4  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 377 aa  96.7  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 		 377 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 		 425 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  35.02 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 		 419 aa  93.2  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  35.68 
 
 		 450 aa  92.8  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 		 376 aa  92.8  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.78 
 
 		 385 aa  92  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 		 370 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 		 345 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 406 aa  90.5  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 		 370 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  32.56 
 
 		 404 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  34.54 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  35.14 
 
 		 370 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 		 439 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 		 439 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 		 439 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2623  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 386 aa  89.4  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  34.66 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  30.45 
 
 		 423 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 438 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  34.27 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 		 440 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  35.27 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 		 443 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 		 385 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 		 443 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 		 443 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 		 365 aa  87.4  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 		 382 aa  87  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 		 498 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 		 443 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 		 495 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 		 499 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 748 aa  86.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 414 aa  86.3  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  30.77 
 
 		 414 aa  86.3  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  34.82 
 
 		 386 aa  85.9  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 424 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  34.62 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  34.53 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1517  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  33.15 
 
 		 650 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>