More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2178 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2178  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
335 aa  701    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3077  metal dependent phosphohydrolase  41.08 
 
 
328 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  41.29 
 
 
328 aa  272  7e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2661  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
327 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  38.07 
 
 
338 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2662  metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 
338 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2293  metal dependent phosphohydrolase  31.86 
 
 
329 aa  196  7e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2714  metal dependent phosphohydrolase  27.62 
 
 
318 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0887  metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 
320 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.665432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3373  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 
320 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2625  metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 
321 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.756444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3495  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 
320 aa  153  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0533  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 
316 aa  146  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.164629  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0057  metal dependent phosphohydrolase  26.35 
 
 
317 aa  146  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0545  metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 
316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0316  metal dependent phosphohydrolase  28.25 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  36.32 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  35.15 
 
 
419 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  41.27 
 
 
414 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
345 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 
411 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 
419 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  35.19 
 
 
427 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  35.32 
 
 
431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  38.2 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.42 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  35.86 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  34.67 
 
 
402 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.8 
 
 
880 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.8 
 
 
860 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  34.18 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0653  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.05 
 
 
345 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6785900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
393 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 
357 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  40.72 
 
 
1171 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  34.67 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  34.22 
 
 
402 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2575  metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 
367 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  34.26 
 
 
362 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 
413 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  39.52 
 
 
212 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  31.53 
 
 
377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  35.83 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 
545 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  37.06 
 
 
619 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  37.72 
 
 
387 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0220  metal dependent phosphohydrolase  37.22 
 
 
371 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.13 
 
 
351 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 
350 aa  126  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
350 aa  126  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  35.08 
 
 
389 aa  126  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  35.62 
 
 
306 aa  125  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  38.1 
 
 
308 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  35.43 
 
 
319 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  39.16 
 
 
649 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 
320 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 
424 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  31.09 
 
 
362 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  34.85 
 
 
349 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  37.95 
 
 
650 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 
320 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  30.88 
 
 
409 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1236  metal dependent phosphohydrolase  35.07 
 
 
574 aa  123  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0497288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
357 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.76 
 
 
346 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 
410 aa  123  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0273  metal dependent phosphohydrolase  36.46 
 
 
534 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.576727  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
353 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  39.16 
 
 
247 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  38.18 
 
 
1335 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2274  metal-dependent phosphohydrolase  36.98 
 
 
442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.293482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 
363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4403  metal dependent phosphohydrolase  41.28 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  37.97 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
349 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 
1313 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.92 
 
 
432 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  37.99 
 
 
599 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1002  metal dependent phosphohydrolase  35.79 
 
 
560 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 
347 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0012  hypothetical protein  28.17 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000839505  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 
446 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  32.73 
 
 
329 aa  119  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 
438 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  33.62 
 
 
1237 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 
868 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.05 
 
 
348 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  40.29 
 
 
564 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2484  metal dependent phosphohydrolase  36.56 
 
 
723 aa  119  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.09 
 
 
841 aa  119  9e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 
413 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1705  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.98 
 
 
471 aa  118  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  33.33 
 
 
1333 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  40.29 
 
 
563 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3199  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.53 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  37.35 
 
 
470 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>