More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2064 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 206 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  60.98 
 
 		 206 aa  248  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  57.56 
 
 		 206 aa  245  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  52.68 
 
 		 206 aa  241  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  55.12 
 
 		 206 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  56.1 
 
 		 210 aa  231  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  50.49 
 
 		 207 aa  217  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  47.57 
 
 		 207 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  49.51 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  49.51 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  49.51 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  49.51 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  49.51 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  49.51 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  49.51 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  49.51 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  49.51 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  49.51 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 		 206 aa  201  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  48.28 
 
 		 206 aa  201  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  50 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  48.04 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  48.31 
 
 		 208 aa  197  7.999999999999999e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  49.76 
 
 		 206 aa  197  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  49.03 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  48.54 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  49.03 
 
 		 207 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  44.88 
 
 		 208 aa  192  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  47.09 
 
 		 207 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  46.08 
 
 		 207 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  47.29 
 
 		 204 aa  187  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 206 aa  186  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  44.88 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  46.8 
 
 		 204 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  47.83 
 
 		 209 aa  184  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  49.22 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  49.22 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  40.49 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  45.25 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  43.14 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  43.48 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  39.02 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  46.88 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  44.93 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  43.14 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  40.49 
 
 		 207 aa  174  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  39.6 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 		 208 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  43.22 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 		 210 aa  168  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  42.51 
 
 		 207 aa  168  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  36.63 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  42.36 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  39.02 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  40.72 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  42.44 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  45.21 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  42.13 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  42.23 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  41.46 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  43.28 
 
 		 210 aa  162  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  43.75 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  44.15 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  44.15 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  44.15 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  46.24 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  41.46 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0422  50S ribosomal protein L4  44.79 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00655238  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  40.1 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  40.1 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  40.91 
 
 		 210 aa  158  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3523  50S ribosomal protein L4  43.07 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000000876425  hitchhiker  0.00000726358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1186  50S ribosomal protein L4/L1e  45.32 
 
 		 217 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  39.71 
 
 		 214 aa  157  9e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  39.37 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  42.56 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  43.48 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0459  50S ribosomal protein L4  42.57 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  41.21 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  40.1 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  40.39 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  41.35 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0427  50S ribosomal protein L4  41.8 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154423  decreased coverage  0.00000614317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  42.38 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03990  LSU ribosomal protein L4P  42 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  41.24 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0290  50S ribosomal protein L4  41.26 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4275  50S ribosomal protein L4  41.24 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000159231  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>