75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1966 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3198  adenylylsulfate reductase subunit alpha  85.35 
 
 		 663 aa  1202    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000352538  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2136  adenylylsulfate reductase subunit alpha  82.53 
 
 		 664 aa  1171    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.290576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.05 
 
 		 634 aa  671    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  58.3 
 
 		 658 aa  795    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000390023  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  58.9 
 
 		 658 aa  799    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2893  adenylylsulfate reductase subunit alpha  83.41 
 
 		 665 aa  1177    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.127343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2129  adenylylsulfate reductase subunit alpha  81.78 
 
 		 662 aa  1137    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  64.81 
 
 		 659 aa  879    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1110  adenylylsulfate reductase subunit alpha  82.5 
 
 		 664 aa  1157    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000990495  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  58.3 
 
 		 657 aa  800    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  51.07 
 
 		 625 aa  638    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1966  adenylylsulfate reductase subunit alpha  100 
 
 		 667 aa  1395    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115626 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  49.85 
 
 		 635 aa  638    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0872  adenylylsulfate reductase subunit alpha  60 
 
 		 673 aa  792    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  52.99 
 
 		 629 aa  627  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  51.14 
 
 		 624 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  44.81 
 
 		 632 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  45.23 
 
 		 622 aa  523  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.16 
 
 		 635 aa  521  1e-146  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  44.33 
 
 		 622 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  42.53 
 
 		 629 aa  491  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  42.43 
 
 		 627 aa  486  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  33.02 
 
 		 574 aa  321  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.46 
 
 		 590 aa  320  5e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.53 
 
 		 591 aa  312  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.75 
 
 		 579 aa  266  8e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.14 
 
 		 594 aa  256  8e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  28.87 
 
 		 566 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  27.68 
 
 		 563 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  24.76 
 
 		 569 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  22.48 
 
 		 576 aa  120  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  21.99 
 
 		 574 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  21.99 
 
 		 574 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  21.71 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  22.31 
 
 		 574 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.51 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  21.85 
 
 		 579 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  21.81 
 
 		 579 aa  106  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  22.26 
 
 		 578 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  22.09 
 
 		 574 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  21.69 
 
 		 579 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  22.83 
 
 		 578 aa  103  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  21.73 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  21.57 
 
 		 579 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  21 
 
 		 579 aa  101  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  21.57 
 
 		 579 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  22.79 
 
 		 954 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  21.42 
 
 		 591 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  20.09 
 
 		 578 aa  91.7  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  20.88 
 
 		 582 aa  89  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  26.4 
 
 		 580 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.34 
 
 		 610 aa  87  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  20.66 
 
 		 582 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  27.33 
 
 		 573 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  20.81 
 
 		 580 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  25.63 
 
 		 583 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  24.09 
 
 		 555 aa  50.8  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.44 
 
 		 564 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.32 
 
 		 601 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.57 
 
 		 598 aa  47.4  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  22.04 
 
 		 534 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  26.18 
 
 		 541 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.21 
 
 		 605 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  24.46 
 
 		 530 aa  45.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.21 
 
 		 605 aa  45.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.21 
 
 		 605 aa  45.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.71 
 
 		 611 aa  45.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  27.54 
 
 		 542 aa  45.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1786  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.04 
 
 		 588 aa  45.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00696319  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0965  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.23 
 
 		 583 aa  44.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.297334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0770  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.28 
 
 		 593 aa  44.3  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.19 
 
 		 598 aa  44.3  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.7 
 
 		 608 aa  44.3  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.03 
 
 		 575 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.42 
 
 		 607 aa  43.9  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>