159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2409 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  61.11 
 
 
102 aa  103  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  51.61 
 
 
99 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  46.39 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  44.79 
 
 
95 aa  84  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.16 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  43.82 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.25 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0056  flagellar hook-basal body protein FliE  38.2 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.44 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  36.17 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.44 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.48 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0691  flagellar hook-basal body protein FliE  41.67 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.65 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  43.9 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.33 
 
 
102 aa  67  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1067  flagellar hook-basal body protein FliE  42.25 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.62 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.28 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  37.89 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  33.8 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  41.67 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0363  flagellar hook-basal body protein FliE  38.67 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  32 
 
 
100 aa  63.5  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.76 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.5 
 
 
100 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.27 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.59 
 
 
100 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.44 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.4 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.44 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.67 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 
107 aa  60.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.21 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0630  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
98 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.632704  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0551  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
98 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.13 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  37.65 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.13 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.62 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1574  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.72 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  31.25 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  34.09 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  34.09 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 
104 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.89 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  40.3 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.97 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  40.3 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  40.3 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  27.27 
 
 
121 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  39.44 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.68 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  39.44 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0052  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  38.57 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.280987  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.07 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1404  flagellar hook-basal body protein FliE  32.18 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.216787  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.29 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.78 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  37.84 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  36.71 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.35 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  38.03 
 
 
104 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  38.03 
 
 
104 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  38.03 
 
 
104 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  38.03 
 
 
104 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.33 
 
 
109 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  38.55 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.95 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  34.78 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  34.78 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0840  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.12 
 
 
102 aa  50.1  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  34.48 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.79 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  32.39 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1643  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.58 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00083398  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  35.21 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  34.48 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  34.48 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  34.48 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.48 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  38.55 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  32.61 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2348  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.23 
 
 
105 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
105 aa  48.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.21 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.15 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  34.21 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.13 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  35.71 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.88 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>