151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2976 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 415 aa  843    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  27.01 
 
 		 400 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  26.42 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  27.16 
 
 		 405 aa  103  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  26.04 
 
 		 367 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  25.72 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  26.09 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  28.57 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  26.17 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  25.13 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  25.06 
 
 		 396 aa  99.8  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  25.97 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  25.7 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  23.96 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  25.49 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  23.56 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  26.02 
 
 		 398 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  25.91 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  24.56 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  23.97 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  25.96 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  25.26 
 
 		 398 aa  93.2  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  25.37 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  24.43 
 
 		 369 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  25.64 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  26.22 
 
 		 409 aa  90.1  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  24.35 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  24.35 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  24.29 
 
 		 396 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  26.04 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  25.96 
 
 		 401 aa  88.2  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  24.63 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  24.16 
 
 		 399 aa  87  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  24.1 
 
 		 401 aa  87  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  24.59 
 
 		 426 aa  86.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  25.77 
 
 		 398 aa  86.3  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  24.52 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  25.19 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  24.88 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  25 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  25.24 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  24.18 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  24.22 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  25.37 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  24.35 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  25.91 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  23.78 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  23.78 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  23.32 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  23.61 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  25.81 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  25.85 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  24.38 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  24.81 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  25 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  24.39 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  27.34 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  23.58 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  25.35 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  23.92 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  25.42 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  22.72 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  24.35 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  26.69 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  23.58 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  23.04 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  23 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  23 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  22.92 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  23.85 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  23.38 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  23.56 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  24.8 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  23.3 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  23.3 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  23.3 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  23.3 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  23.3 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  24.22 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  26.53 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  26.94 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  22.56 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1404  saccharopine dehydrogenase  26 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  21.96 
 
 		 384 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  23.79 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  24.77 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  24.77 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  24.07 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  26.72 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  24.54 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  30.67 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  31.39 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  35.35 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  24.07 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  23.73 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2081  saccharopine dehydrogenase  33.57 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  28.57 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  26.54 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>