More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1173 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  44.26 
 
 		 188 aa  157  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  44.79 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  43.1 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  42.19 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  53.85 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  40.41 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  41.21 
 
 		 211 aa  140  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  41.81 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  52.85 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  41.48 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  40.31 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  51.91 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  52.63 
 
 		 146 aa  138  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  53.33 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  50.75 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  46.2 
 
 		 251 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  54.24 
 
 		 174 aa  135  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  42.05 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  51.22 
 
 		 199 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  37.97 
 
 		 204 aa  134  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  39.49 
 
 		 237 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 216 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  40.72 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  40.72 
 
 		 239 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  40.72 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  40.98 
 
 		 199 aa  131  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.92 
 
 		 239 aa  131  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  43.98 
 
 		 242 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.35 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  42.17 
 
 		 247 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  42.11 
 
 		 221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  50.86 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  52.38 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  48.39 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  40.29 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  42.17 
 
 		 243 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  43.35 
 
 		 200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  50.36 
 
 		 260 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  40.84 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  51.49 
 
 		 260 aa  128  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  39.52 
 
 		 251 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  39.52 
 
 		 251 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  39.52 
 
 		 251 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  55.08 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  39.76 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  41.92 
 
 		 299 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  41.21 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  41.21 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  41.99 
 
 		 209 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  52.5 
 
 		 291 aa  124  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  46.92 
 
 		 189 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  49.6 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  41.32 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  48.87 
 
 		 247 aa  123  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  49.6 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  51.24 
 
 		 261 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.39 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  45.53 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  50.83 
 
 		 258 aa  121  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  45.08 
 
 		 280 aa  121  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  49.6 
 
 		 282 aa  121  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 283 aa  120  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  44.72 
 
 		 261 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  44.72 
 
 		 261 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  44.72 
 
 		 261 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  40.22 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  39.76 
 
 		 329 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  44.72 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  53.98 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  40.22 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  51.72 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  39.67 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  44.72 
 
 		 261 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  40.72 
 
 		 326 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  43.9 
 
 		 261 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  43.9 
 
 		 261 aa  118  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  37.63 
 
 		 215 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  43.9 
 
 		 259 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  38.86 
 
 		 216 aa  117  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  39.06 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  40.22 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  47.1 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  48.72 
 
 		 438 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  54.72 
 
 		 258 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  46.9 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  42.19 
 
 		 305 aa  115  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  37.57 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  41.41 
 
 		 273 aa  115  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  50.85 
 
 		 318 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  46.38 
 
 		 218 aa  114  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  43.09 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  34.95 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  48.31 
 
 		 245 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  46.72 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  48.33 
 
 		 370 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  37.36 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 327 aa  111  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>