247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1183 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1401  heat-inducible transcription repressor HrcA  96.52 
 
 		 345 aa  686    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1210  heat-inducible transcription repressor HrcA  95.94 
 
 		 345 aa  678    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297014  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 		 345 aa  709    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  40 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.84 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.35 
 
 		 354 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.28 
 
 		 376 aa  216  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.47 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.51 
 
 		 351 aa  179  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.65 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.91 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.64 
 
 		 343 aa  169  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 		 343 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.14 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.94 
 
 		 343 aa  165  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.65 
 
 		 343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.23 
 
 		 350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  31.93 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  31.69 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.62 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  31.93 
 
 		 338 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  30.72 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.25 
 
 		 342 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.52 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  31.33 
 
 		 338 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  31.63 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  31.08 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  31.08 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  30.23 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.82 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  31.08 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  31.08 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.06 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  30 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.95 
 
 		 343 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.42 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.79 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.53 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  28.94 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.51 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  30.29 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.4 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.21 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  28.95 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.76 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  29.85 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.36 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.88 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.76 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.19 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.19 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.9 
 
 		 365 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.5 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  29.04 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  31.02 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  29.46 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  28.73 
 
 		 360 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.14 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.65 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.53 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.09 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  29.78 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.39 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  27.91 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  28.91 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  27.91 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.91 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  31.37 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  28.7 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.26 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  31.38 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  31.09 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  28.78 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.18 
 
 		 357 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.57 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  30.61 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.09 
 
 		 340 aa  143  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  30.63 
 
 		 339 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  27.41 
 
 		 385 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  27.41 
 
 		 385 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  27.81 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  27.81 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  28.02 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  28.02 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  28.02 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  27.81 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  27.81 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  27.81 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  31.93 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  28.23 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  30.52 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  31.27 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  28.49 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  30.11 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.82 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  30.11 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  28.27 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  30.79 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  29.73 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>