More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4278 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  54.68 
 
 
154 aa  140  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  61.74 
 
 
156 aa  134  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  49.62 
 
 
156 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  45.39 
 
 
158 aa  130  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  46.5 
 
 
301 aa  130  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  49.25 
 
 
446 aa  130  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  49.26 
 
 
156 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  50.74 
 
 
156 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  47.33 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  49.28 
 
 
156 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  49.28 
 
 
156 aa  127  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  49.28 
 
 
156 aa  127  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  49.28 
 
 
156 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  49.28 
 
 
156 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  49.28 
 
 
156 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  49.28 
 
 
156 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  51.91 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  47.68 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  51.85 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  49.62 
 
 
156 aa  120  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  46 
 
 
174 aa  120  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  46.62 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  50.82 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  52.85 
 
 
155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  52.85 
 
 
155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  48.55 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  56.3 
 
 
157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  42 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  41.33 
 
 
168 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  42.48 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  52.59 
 
 
153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  46.81 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  42.41 
 
 
161 aa  110  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  42.75 
 
 
162 aa  110  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  44.59 
 
 
159 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  45.08 
 
 
180 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  47.5 
 
 
152 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  42.65 
 
 
153 aa  103  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  44.54 
 
 
154 aa  102  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  44.07 
 
 
183 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  41.67 
 
 
161 aa  101  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  43.51 
 
 
162 aa  101  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  40.91 
 
 
165 aa  100  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  44.09 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  49.59 
 
 
149 aa  99  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  50 
 
 
174 aa  98.6  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  40.44 
 
 
190 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  41.23 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  44.44 
 
 
147 aa  96.3  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  39.06 
 
 
195 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  40.83 
 
 
190 aa  94  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  42.98 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  45.08 
 
 
176 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  36.62 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  41.44 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  42.15 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  43.97 
 
 
157 aa  90.9  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  42.24 
 
 
161 aa  90.5  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  40.97 
 
 
200 aa  90.1  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  36.88 
 
 
171 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  43.1 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  43.97 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  43.1 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  36.6 
 
 
168 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  39.66 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  43.1 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0477  putative metalloprotease  41.18 
 
 
134 aa  89.7  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  43.1 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  40 
 
 
176 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2732  protein of unknown function UPF0054  47.27 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  40 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  40 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  35.53 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  35.53 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  42.24 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  37.04 
 
 
175 aa  87.8  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  35.14 
 
 
172 aa  87.4  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  39.13 
 
 
154 aa  87.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  35.03 
 
 
162 aa  87.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  40.41 
 
 
165 aa  87  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  37.04 
 
 
171 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  43.69 
 
 
178 aa  87  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  42.11 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  41.41 
 
 
195 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  43.69 
 
 
184 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  39.5 
 
 
185 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  37.7 
 
 
189 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  38.79 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  39.66 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  48.11 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  42.37 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1782  hypothetical protein  40.31 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000233971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  40.52 
 
 
167 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  36.96 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2305  protein of unknown function UPF0054  44.95 
 
 
172 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154863  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  40.62 
 
 
143 aa  85.1  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  42.24 
 
 
169 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  41.38 
 
 
161 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  47.17 
 
 
170 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>