More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0522 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0522  histidine kinase  100 
 
 
331 aa  674    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.24 
 
 
350 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1309  sensor histidine kinase  38.85 
 
 
323 aa  228  1e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000599634  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1092  histidine kinase  38.85 
 
 
303 aa  202  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0835  Signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
331 aa  183  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0874026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5199  sensor histidine kinase  36.18 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0656  sensor histidine kinase, putative  38.16 
 
 
357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0734197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2647  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
295 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2703  ATPase domain-containing protein  32.27 
 
 
295 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1909  Signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
291 aa  170  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2176  histidine kinase  35.48 
 
 
368 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03370  signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
347 aa  160  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2205  sensor histidine kinase, putative  38.42 
 
 
301 aa  159  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0116  sensor histidine kinase  34.4 
 
 
337 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0322042  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1081  histidine kinase  32.13 
 
 
346 aa  155  8e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0118  sensor histidine kinase  34.4 
 
 
337 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.151918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0494  histidine kinase  30.5 
 
 
340 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.752547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2323  histidine kinase  33.12 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0514446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2539  histidine kinase  33.33 
 
 
327 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2344  sensor histidine kinase  32.25 
 
 
334 aa  142  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00230354  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2656  sensor protein YxdK  32.13 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2379  two-component sensor histidine kinase  32.57 
 
 
334 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00984637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2571  sensor protein YxdK  32.98 
 
 
276 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.86964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2618  sensor histidine kinase, putative  31.92 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0136174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2615  sensor histidine kinase  31.6 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000946507 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1416  histidine kinase  34.24 
 
 
342 aa  139  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122743  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2753  sensor histidine kinase  32.98 
 
 
279 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130626 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0837  sensor histidine kinase  36.89 
 
 
336 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0398077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0831  sensor histidine kinase  31.76 
 
 
336 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0938177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2421  sensor histidine kinase, C-terminal  34.22 
 
 
252 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4172  two-component sensor histidine kinase  29.94 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.420668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4518  sensor histidine kinase  30.5 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4530  sensor histidine kinase  32.01 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0678  sensor histidine kinase  29.62 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238999  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0977  sensor histidine kinase  26.89 
 
 
312 aa  134  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4183  sensor histidine kinase  31.46 
 
 
370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4571  sensor histidine kinase  30.21 
 
 
360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  29.75 
 
 
340 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2305  histidine kinase  30.56 
 
 
328 aa  132  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000217968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4335  histidine kinase-like ATPase  35.55 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4284  histidine kinase  32.13 
 
 
360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.895654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  29.45 
 
 
340 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  29.45 
 
 
340 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  29.45 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  29.45 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  29.45 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  29.45 
 
 
340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  30.06 
 
 
340 aa  129  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  29.14 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  29.14 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4556  sensor histidine kinase  29.62 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0313  sensor histidine kinase  30.28 
 
 
346 aa  126  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0698  ATPase domain-containing protein  29.36 
 
 
346 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.541747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3153  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
360 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
346 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.132473  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
326 aa  122  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
686 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  29.72 
 
 
441 aa  92.8  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  28.27 
 
 
593 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  27.01 
 
 
747 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  26.77 
 
 
606 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  29.81 
 
 
464 aa  89.7  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
608 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.4 
 
 
1138 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 
581 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3020  histidine kinase  27.27 
 
 
631 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249854  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
792 aa  85.9  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 
781 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
612 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
513 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124694  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 
1127 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
1140 aa  83.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
655 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03837  Signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 
623 aa  83.2  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2327  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 
591 aa  83.2  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1757  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 
614 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
444 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
394 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
587 aa  82.4  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.04 
 
 
653 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  25.78 
 
 
604 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
610 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3153  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1567  sensory transduction histidine kinase  28.77 
 
 
855 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
1383 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2154  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 
815 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990707  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0218  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 
855 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.227193  normal  0.9118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  26.12 
 
 
1150 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2361  two component sensor histidine kinase  29.73 
 
 
827 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
1131 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 
1124 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  29.58 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  28.33 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>