More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0408 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
174 aa  345  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  54.86 
 
 
175 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  54.97 
 
 
176 aa  184  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  56.73 
 
 
181 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  52.87 
 
 
176 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  53.85 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  50.58 
 
 
166 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  50.58 
 
 
166 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  48.26 
 
 
172 aa  158  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  50.29 
 
 
166 aa  156  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  50.58 
 
 
166 aa  155  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  47.27 
 
 
179 aa  155  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  53.74 
 
 
166 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  48.82 
 
 
176 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  43.82 
 
 
178 aa  149  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  44 
 
 
175 aa  148  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  49.12 
 
 
166 aa  148  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  49.12 
 
 
166 aa  147  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  49.12 
 
 
166 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  49.12 
 
 
166 aa  147  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  49.12 
 
 
166 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  49.12 
 
 
166 aa  147  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  49.12 
 
 
166 aa  147  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  49.12 
 
 
166 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  49.12 
 
 
166 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  49.12 
 
 
166 aa  147  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  49.12 
 
 
166 aa  147  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  46.24 
 
 
174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  47.65 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  45.88 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  47.09 
 
 
177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  47.95 
 
 
174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  45.61 
 
 
173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  45.83 
 
 
176 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  45.93 
 
 
173 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  45.93 
 
 
173 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  46.24 
 
 
171 aa  141  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  51.05 
 
 
166 aa  141  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  51.05 
 
 
166 aa  141  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  50 
 
 
174 aa  140  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  48.03 
 
 
174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  47.95 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  44.31 
 
 
172 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  48.03 
 
 
174 aa  137  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  44.64 
 
 
172 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  49.02 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  45.34 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  48.37 
 
 
215 aa  135  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  47.31 
 
 
174 aa  135  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  49.33 
 
 
168 aa  134  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  49.65 
 
 
167 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  44.71 
 
 
187 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  49.37 
 
 
181 aa  134  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  44.44 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  48.37 
 
 
173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  45.81 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  46.75 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  46.2 
 
 
174 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 
174 aa  132  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  48.67 
 
 
174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  45.4 
 
 
203 aa  131  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  47.06 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  43.71 
 
 
183 aa  128  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  46.84 
 
 
168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  46.84 
 
 
168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  47.71 
 
 
165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  41.98 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  42.59 
 
 
176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  42.68 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  45.75 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  41.67 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  45.75 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  45.75 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  45.29 
 
 
173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
182 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  44.71 
 
 
176 aa  125  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  45.75 
 
 
165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  42.94 
 
 
172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  45.24 
 
 
172 aa  124  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  45.03 
 
 
184 aa  124  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  45.88 
 
 
175 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  44.03 
 
 
190 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  40.83 
 
 
167 aa  122  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  42.26 
 
 
197 aa  121  4e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  44.67 
 
 
171 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2990  50S ribosomal protein L10  52.27 
 
 
196 aa  121  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.302741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  45.64 
 
 
202 aa  120  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  41.46 
 
 
166 aa  120  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  44.58 
 
 
174 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  52.27 
 
 
197 aa  120  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  45.86 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  40.62 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  43.11 
 
 
181 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  44.71 
 
 
212 aa  118  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  46.71 
 
 
228 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  42.07 
 
 
178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  39.87 
 
 
172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 
173 aa  117  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  41.76 
 
 
173 aa  117  7e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  47.73 
 
 
182 aa  117  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>