More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1380 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1380  alanine racemase  100 
 
 		 355 aa  705    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000410979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  41.13 
 
 		 370 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  36.89 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  37.84 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  37.53 
 
 		 373 aa  212  7e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  36.71 
 
 		 373 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  39.94 
 
 		 371 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  41.74 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  34.84 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  36.6 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  36.44 
 
 		 373 aa  206  7e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  36.53 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  35.81 
 
 		 379 aa  202  8e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  36.84 
 
 		 364 aa  202  9e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  40.81 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  34.54 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  39.73 
 
 		 372 aa  194  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  36.64 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  39.08 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  37.67 
 
 		 373 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  34.08 
 
 		 388 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  33.98 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  34.85 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  38.65 
 
 		 421 aa  189  7e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  32.04 
 
 		 374 aa  189  8e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  32.75 
 
 		 373 aa  189  8e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  38.38 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  35.29 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  34.95 
 
 		 390 aa  186  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  35.16 
 
 		 377 aa  186  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  38.44 
 
 		 379 aa  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0357  alanine racemase  42.12 
 
 		 400 aa  185  9e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  37.13 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  33.7 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  37.6 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  33.42 
 
 		 386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  36.19 
 
 		 403 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  37.63 
 
 		 379 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  34.44 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  33.06 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  37.1 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  37.7 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  37.3 
 
 		 403 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  39.15 
 
 		 390 aa  179  9e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  39.89 
 
 		 811 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4025  alanine racemase  36.36 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  37.91 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  38.71 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  37.36 
 
 		 366 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  39.39 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  36.76 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  34.24 
 
 		 371 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  38.67 
 
 		 851 aa  175  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  38.32 
 
 		 380 aa  175  9e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1635  alanine racemase region  34.62 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  37.53 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  36.46 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  39 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  38.32 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  36.04 
 
 		 382 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  38.72 
 
 		 395 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  37.95 
 
 		 368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_002950  PG1097  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  33.33 
 
 		 823 aa  173  5e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.430466 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  38.27 
 
 		 395 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  39.17 
 
 		 393 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  31.58 
 
 		 391 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  40.28 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00596  alanine racemase  35.44 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  39.02 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  30.73 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  37.87 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  31.64 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  31.58 
 
 		 391 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2606  alanine racemase  38.34 
 
 		 374 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0198  alanine racemase  34.97 
 
 		 324 aa  169  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  37.08 
 
 		 375 aa  169  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  33.88 
 
 		 376 aa  169  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  33.24 
 
 		 376 aa  169  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0939  alanine racemase  33.9 
 
 		 359 aa  169  8e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  35.83 
 
 		 356 aa  169  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  36.54 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  31.49 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  31.02 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  31.3 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  31.49 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  31.04 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  36.97 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  31.48 
 
 		 842 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  37.57 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  31.02 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  34.68 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  38.87 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  30.85 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  35.85 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  30.87 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  37.09 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0933  alanine racemase  29.6 
 
 		 342 aa  166  4e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  38.44 
 
 		 357 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  36.26 
 
 		 402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  35.03 
 
 		 395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>