More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2317 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 426 aa  868    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  63.31 
 
 		 386 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  65.14 
 
 		 481 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  55.36 
 
 		 385 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  48.74 
 
 		 425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  47.16 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  44.72 
 
 		 397 aa  323  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  43.77 
 
 		 384 aa  316  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  43.48 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  44.38 
 
 		 389 aa  300  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  41.98 
 
 		 385 aa  299  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  40.86 
 
 		 391 aa  296  4e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  39.59 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  41.18 
 
 		 393 aa  291  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  39.59 
 
 		 390 aa  289  7e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  41.18 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  42.39 
 
 		 415 aa  279  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  42.01 
 
 		 417 aa  280  5e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  43.54 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  48.82 
 
 		 355 aa  277  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  43.03 
 
 		 418 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.6 
 
 		 415 aa  276  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  45.98 
 
 		 418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  45.27 
 
 		 419 aa  273  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  46.94 
 
 		 378 aa  274  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  46.94 
 
 		 378 aa  274  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  42.34 
 
 		 410 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  42.53 
 
 		 420 aa  273  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  42.82 
 
 		 409 aa  272  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  44.38 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  45.36 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  45.17 
 
 		 363 aa  272  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  42.73 
 
 		 369 aa  270  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  42.6 
 
 		 360 aa  270  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  44.8 
 
 		 354 aa  269  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  45.1 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  41.34 
 
 		 436 aa  267  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.01 
 
 		 414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  45.05 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  43.36 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  43.24 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  38.52 
 
 		 409 aa  265  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  45.7 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  37.31 
 
 		 409 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  41.79 
 
 		 429 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  39.74 
 
 		 410 aa  263  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  41.81 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  40.36 
 
 		 436 aa  263  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  40.51 
 
 		 408 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  43.01 
 
 		 422 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  42.31 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  42.94 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  43.36 
 
 		 371 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  41.37 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  44.29 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  42.23 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  42.9 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  42.75 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  41.43 
 
 		 408 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  40.87 
 
 		 417 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  44.73 
 
 		 369 aa  259  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  40.87 
 
 		 449 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  43.36 
 
 		 378 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  41.56 
 
 		 406 aa  259  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  39.02 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  39.02 
 
 		 445 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  38.6 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  43.32 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  40.56 
 
 		 418 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  42.6 
 
 		 375 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  42.27 
 
 		 359 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  39.23 
 
 		 431 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  43.79 
 
 		 359 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  40.72 
 
 		 423 aa  256  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  44.97 
 
 		 374 aa  255  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  44.41 
 
 		 359 aa  255  9e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  39.11 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  36.7 
 
 		 407 aa  254  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  41.59 
 
 		 371 aa  253  3e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  36.04 
 
 		 409 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  38.23 
 
 		 410 aa  254  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  40.73 
 
 		 430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  41.71 
 
 		 432 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  42.81 
 
 		 357 aa  253  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  42.9 
 
 		 424 aa  253  6e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  43.71 
 
 		 356 aa  252  7e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  40.23 
 
 		 364 aa  252  8.000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  40.51 
 
 		 417 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  41.12 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  40.82 
 
 		 435 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  36.87 
 
 		 411 aa  252  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  40.67 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  41.94 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  44.9 
 
 		 466 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  42.6 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  36.28 
 
 		 409 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  38.3 
 
 		 431 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  39.95 
 
 		 423 aa  250  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  44.02 
 
 		 361 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>