94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2184 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 193 aa  381  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  49.18 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.6 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  44.2 
 
 		 192 aa  135  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  43.93 
 
 		 192 aa  128  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.87 
 
 		 189 aa  97.8  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.65 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3410  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.39 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00419631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3174  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.88 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.519185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0109  ATP synthase F0, B subunit  35.53 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  28.85 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  29.38 
 
 		 175 aa  62  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.22 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.65 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  27.16 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  27.06 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  28.14 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  29.38 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  29.81 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  29.27 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 		 164 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  26.47 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1734  F0F1 ATP synthase subunit B  29.25 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  33.11 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  33.11 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1529  F0F1 ATP synthase subunit B  25.87 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11288  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  25.16 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1503  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.1 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0602  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.1 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0138  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.815294  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  23.81 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  28 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  27.5 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4259  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.96 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00611055  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  36.8 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  30.26 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0913  F0F1 ATP synthase subunit B  29.2 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000548594  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  24.43 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  24.24 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  25.17 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  38.16 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04811  F0F1 ATP synthase subunit B  30.54 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  23.65 
 
 		 175 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  25.31 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1407  F0F1 ATP synthase subunit B  26.85 
 
 		 169 aa  51.6  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.969666  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0098  F0F1 ATP synthase subunit B  27.64 
 
 		 170 aa  51.6  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  25.52 
 
 		 177 aa  51.2  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  25.47 
 
 		 175 aa  51.2  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  27.67 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  24.69 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  26.35 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  23.84 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  27.63 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  23.65 
 
 		 181 aa  48.1  0.00008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  24.32 
 
 		 177 aa  47.8  0.00009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  29.91 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.25 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  27.85 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18511  F0F1 ATP synthase subunit B  23.31 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0983  F0F1 ATP synthase subunit B  23.31 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  26.97 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  23.65 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  28.79 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 168 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0683  F0F1 ATP synthase subunit B  26.29 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.883671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  23.65 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  25.85 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  26.28 
 
 		 163 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0879  ATP synthase F0, B subunit  27.27 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0191  F0F1 ATP synthase subunit B  24.82 
 
 		 170 aa  45.1  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.658435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  26.67 
 
 		 796 aa  44.7  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  25.81 
 
 		 159 aa  44.7  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  33.59 
 
 		 166 aa  44.7  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  30.22 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  22.52 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  22.52 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  25.17 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  24.49 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16431  F0F1 ATP synthase subunit B  22.09 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4039  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.19 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0125967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  25.64 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.65 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  28.79 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  23.78 
 
 		 156 aa  42  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0511  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.19 
 
 		 171 aa  42  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3954  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.19 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0263708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  29.87 
 
 		 163 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  23.4 
 
 		 166 aa  41.6  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2166  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 		 154 aa  41.2  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  27.15 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>