More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1076 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  100 
 
 		 278 aa  567  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  68.82 
 
 		 281 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  65.59 
 
 		 280 aa  362  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  62.63 
 
 		 283 aa  355  2.9999999999999997e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  67.97 
 
 		 281 aa  345  4e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.41 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.77 
 
 		 284 aa  300  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.77 
 
 		 284 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.57 
 
 		 276 aa  291  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.51 
 
 		 290 aa  290  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.04 
 
 		 296 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.74 
 
 		 281 aa  286  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.04 
 
 		 286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  54.23 
 
 		 285 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.82 
 
 		 309 aa  281  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.33 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.54 
 
 		 277 aa  281  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.11 
 
 		 291 aa  279  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  53.11 
 
 		 291 aa  279  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.47 
 
 		 288 aa  279  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.54 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.14 
 
 		 293 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  46.6 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.83 
 
 		 294 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.48 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.34 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.85 
 
 		 284 aa  259  4e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.28 
 
 		 329 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.43 
 
 		 298 aa  252  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.52 
 
 		 277 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.07 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  40 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  35.56 
 
 		 338 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  35 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.16 
 
 		 328 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  33.23 
 
 		 333 aa  159  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  31.41 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  32.37 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.78 
 
 		 203 aa  151  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  32.37 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  33.12 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  32.37 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  33.44 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  32.92 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.25 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.96 
 
 		 203 aa  149  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  41.05 
 
 		 203 aa  147  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  40 
 
 		 203 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  40.84 
 
 		 203 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.78 
 
 		 203 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  30.28 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  35.51 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  52.54 
 
 		 125 aa  138  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  47.89 
 
 		 150 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.28 
 
 		 127 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.92 
 
 		 145 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.24 
 
 		 142 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  52.24 
 
 		 144 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.27 
 
 		 203 aa  136  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  50.85 
 
 		 149 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.08 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.07 
 
 		 154 aa  134  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.57 
 
 		 124 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  47.86 
 
 		 146 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.43 
 
 		 138 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50 
 
 		 124 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  45.32 
 
 		 144 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.43 
 
 		 137 aa  129  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  46.22 
 
 		 137 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  50.85 
 
 		 173 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  50 
 
 		 129 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  51.28 
 
 		 143 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  48.72 
 
 		 123 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.59 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  49.59 
 
 		 153 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  48.76 
 
 		 153 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  42.96 
 
 		 143 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  48.76 
 
 		 153 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  50.41 
 
 		 126 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  43.22 
 
 		 129 aa  122  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  45.3 
 
 		 129 aa  122  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  47.11 
 
 		 130 aa  122  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  49.59 
 
 		 127 aa  122  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  44.85 
 
 		 153 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  45.6 
 
 		 127 aa  120  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  44.92 
 
 		 122 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  48.76 
 
 		 127 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.45 
 
 		 153 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  46.28 
 
 		 153 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  47.15 
 
 		 133 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  47.15 
 
 		 139 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  47.15 
 
 		 127 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  47.93 
 
 		 127 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  47.15 
 
 		 128 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  47.15 
 
 		 128 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  47.15 
 
 		 128 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  47.15 
 
 		 128 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  47.11 
 
 		 211 aa  119  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  47.15 
 
 		 128 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  47.01 
 
 		 128 aa  118  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>