279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2892 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  100 
 
 
621 aa  1295    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1423  methyltransferase type 11  41.2 
 
 
279 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1147  methyltransferase type 12  38.62 
 
 
288 aa  147  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  25.16 
 
 
1162 aa  76.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1253  hypothetical protein  31.4 
 
 
255 aa  75.5  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470333  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  26.79 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  26.24 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4045  Methyltransferase type 12  28.15 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741361 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  25.85 
 
 
331 aa  62.4  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  25.85 
 
 
331 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  32.38 
 
 
331 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  32.38 
 
 
331 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  24 
 
 
333 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.98 
 
 
247 aa  58.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  24.48 
 
 
376 aa  58.2  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  31.43 
 
 
358 aa  58.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  31.43 
 
 
331 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  28.15 
 
 
215 aa  56.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0721  hypothetical protein  30.16 
 
 
360 aa  56.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  28.07 
 
 
219 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  29.32 
 
 
215 aa  55.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.68 
 
 
234 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  29.03 
 
 
377 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31 
 
 
232 aa  55.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  30.53 
 
 
237 aa  55.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 
273 aa  54.7  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  27.21 
 
 
286 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0172  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
991 aa  53.9  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.87 
 
 
258 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.22 
 
 
248 aa  53.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.22 
 
 
248 aa  53.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 
266 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
270 aa  53.5  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.28 
 
 
238 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.73 
 
 
232 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  30.15 
 
 
318 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  31.53 
 
 
243 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
634 aa  53.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  33.94 
 
 
237 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.89 
 
 
240 aa  52.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.3 
 
 
237 aa  52  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.3 
 
 
237 aa  52  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  24.75 
 
 
210 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  21.02 
 
 
1288 aa  51.6  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 
274 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0456  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 
1103 aa  52  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.713819  normal  0.332791 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0458  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
1087 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.926775  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
240 aa  51.2  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  29.41 
 
 
424 aa  51.2  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.1 
 
 
232 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  26 
 
 
291 aa  51.2  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.28 
 
 
252 aa  50.8  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.48 
 
 
247 aa  50.8  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 
711 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  31.4 
 
 
382 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 
268 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  26.76 
 
 
638 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  33.66 
 
 
257 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1647  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.83 
 
 
436 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0262651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
289 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
268 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 
332 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 
232 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
248 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 
268 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 
265 aa  50.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.69 
 
 
239 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  25.61 
 
 
305 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 
232 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1446  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  22.96 
 
 
388 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220597  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 
232 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 
232 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  30.63 
 
 
199 aa  49.3  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.69 
 
 
239 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2131  hypothetical protein  19.84 
 
 
220 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.967434  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  30 
 
 
266 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
327 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0517  methyltransferase type 12  27.73 
 
 
338 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 
272 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 
232 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
710 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
457 aa  48.9  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.63 
 
 
423 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.68 
 
 
249 aa  48.9  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1112  methyltransferase type 11  24.21 
 
 
246 aa  48.9  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0760451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3355  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
285 aa  48.9  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.109468  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.59 
 
 
238 aa  48.9  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
314 aa  48.9  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1047  hypothetical protein  33.67 
 
 
360 aa  48.5  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  26.55 
 
 
258 aa  48.5  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 
232 aa  48.5  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30 
 
 
213 aa  48.5  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
246 aa  48.5  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
237 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.16 
 
 
429 aa  48.5  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107319  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  23.24 
 
 
323 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29 
 
 
253 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 
390 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.43 
 
 
244 aa  48.1  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  28.46 
 
 
283 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>