More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0256 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0256  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
355 aa  710    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2384  glycosyl transferase group 1  55.04 
 
 
374 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  44.82 
 
 
357 aa  269  7e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1755  glycosyl transferase group 1  43.84 
 
 
358 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0330  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
368 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.79 
 
 
366 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
401 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.98 
 
 
365 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
377 aa  99.4  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  38.02 
 
 
739 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
382 aa  93.2  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
387 aa  92.8  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
395 aa  92.8  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0185  glycosyl tranferase  25.89 
 
 
343 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.472574  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0238  glycosyl tranferase  25.89 
 
 
343 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
393 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 
363 aa  90.5  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
355 aa  89.7  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
904 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
367 aa  86.3  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
750 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  27.39 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
374 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
419 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
440 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  25.08 
 
 
778 aa  77.8  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  27.27 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  22.97 
 
 
367 aa  77  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
468 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  27.34 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  26.5 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.8 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
462 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 
445 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  24.59 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.84 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.36 
 
 
419 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  27.87 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 
370 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
413 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.14 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.93 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  31.03 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  28.8 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>