67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3923 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4109  hypothetical protein  80.09 
 
 		 427 aa  719    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3923  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  874    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0032  hypothetical protein  70.21 
 
 		 434 aa  629  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0037  hypothetical protein  68.79 
 
 		 428 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0046  hypothetical protein  69.1 
 
 		 426 aa  610  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0009  hypothetical protein  68.33 
 
 		 433 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4201  putative ATP/GTP-binding protein  58.91 
 
 		 408 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4039  putative cytoplasmic protein  59.14 
 
 		 408 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0014  conserved hypothetical protein  59.56 
 
 		 404 aa  485  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03516  hypothetical protein  58.43 
 
 		 404 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0014  hypothetical protein  59.56 
 
 		 404 aa  485  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4198  hypothetical protein  58.43 
 
 		 404 aa  488  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3901  hypothetical protein  58.19 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03572  hypothetical protein  58.43 
 
 		 404 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4054  hypothetical protein  59.31 
 
 		 404 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0011  putative ATP/GTP-binding protein  57.48 
 
 		 408 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5122  hypothetical protein  58.09 
 
 		 416 aa  475  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.116872 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4230  hypothetical protein  59.2 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4309  hypothetical protein  34.92 
 
 		 460 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0549386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  28 
 
 		 1062 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  31.67 
 
 		 572 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  29.09 
 
 		 1066 aa  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  32.2 
 
 		 443 aa  50.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  28.18 
 
 		 1069 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  31.58 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  28.18 
 
 		 1081 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  32.38 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  32.38 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  29.41 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 		 642 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  21.99 
 
 		 354 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  27.27 
 
 		 1062 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  28.33 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  27.12 
 
 		 1062 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  27.27 
 
 		 1062 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  29.66 
 
 		 1138 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  27.27 
 
 		 1062 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  27.27 
 
 		 1067 aa  47.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.32 
 
 		 673 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  27.27 
 
 		 445 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  31.43 
 
 		 434 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  32.95 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  27.27 
 
 		 1062 aa  47  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.62 
 
 		 682 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  27.27 
 
 		 1060 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  29.06 
 
 		 1005 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1818  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.58 
 
 		 692 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0201758  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.71 
 
 		 660 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  27.68 
 
 		 1071 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  26.36 
 
 		 1062 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.57 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  25.45 
 
 		 1062 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  25.45 
 
 		 1062 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  31.45 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.66 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  25.45 
 
 		 1049 aa  44.3  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  24.55 
 
 		 1065 aa  44.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  27.64 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  27.59 
 
 		 441 aa  43.9  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  29.57 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  23.81 
 
 		 1028 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  32.32 
 
 		 424 aa  43.5  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.67 
 
 		 708 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  37.74 
 
 		 1111 aa  43.5  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 938 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.81 
 
 		 610 aa  43.1  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 461 aa  43.1  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>