53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3225 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 93 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3224  transcriptional regulator, XRE family  67.05 
 
 		 88 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3425  transcriptional regulator, XRE family  73.68 
 
 		 86 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0260423  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1498  transcriptional regulator, XRE family  56.18 
 
 		 92 aa  120  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1497  transcriptional regulator, XRE family  67.09 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4126  XRE family transcriptional regulator  65.82 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3724  DNA binding protein  59.34 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1541  XRE family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000893114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2922  XRE family transcriptional regulator  59.21 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371341  hitchhiker  0.000558445 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1513  transcriptional regulator, XRE family  55.26 
 
 		 95 aa  86.7  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1692  transcriptional regulator, XRE family  52.63 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4267  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043882  hitchhiker  0.0000172239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1691  transcriptional regulator, XRE family  52.63 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0429  XRE family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0144  transcriptional regulator, XRE family  51.39 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000142855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4266  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773837  hitchhiker  0.00000479642 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4123  transcriptional regulator, XRE family  46.75 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6926  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0430  XRE family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00281269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4121  transcriptional regulator, XRE family  44.16 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00277725  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2452  hypothetical protein  43.59 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28130  hypothetical protein  43.59 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00390916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4406  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4196  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3494  I C protein  42.31 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3154  XRE family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000123737  hitchhiker  0.00000000000122255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0145  transcriptional regulator, XRE family  51.52 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4176  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5932  transcriptional regulator, XRE family  46.48 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3859  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0153162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1512  putative transcriptional regulator  56.9 
 
 		 78 aa  67  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6784  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6488  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2553  DNA-binding transcriptional regulator  37.25 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  41.54 
 
 		 347 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  40 
 
 		 206 aa  48.9  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 435 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0914  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 359 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 321 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 187 aa  41.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1248  DNA-binding protein  36.49 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.821781  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  31.82 
 
 		 395 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  36.51 
 
 		 372 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  42.37 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>