More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0884 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  55.61 
 
 		 191 aa  222  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  57.61 
 
 		 187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  56.52 
 
 		 184 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  52.75 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  52.75 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  51.08 
 
 		 186 aa  201  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  51.08 
 
 		 186 aa  201  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  51.08 
 
 		 186 aa  201  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  51.08 
 
 		 186 aa  201  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  51.08 
 
 		 186 aa  201  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  51.08 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  51.08 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  50.81 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  50.81 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  50.81 
 
 		 186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  50.27 
 
 		 186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  51.93 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  51.4 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  54.6 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  48.65 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  48.65 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  48.65 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  48.65 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  48.11 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  47.57 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  51.1 
 
 		 188 aa  187  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  51.1 
 
 		 188 aa  187  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  48.65 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  51.41 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  49.2 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  51.65 
 
 		 188 aa  181  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  51.65 
 
 		 188 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  48.07 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  51.53 
 
 		 183 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  50.81 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  51.06 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  45.4 
 
 		 207 aa  141  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  41.11 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  50 
 
 		 129 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 		 192 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  38.12 
 
 		 196 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  46.92 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  38.8 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  42.13 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  42.13 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  35.71 
 
 		 192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  39.34 
 
 		 184 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  36.17 
 
 		 203 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  39.27 
 
 		 194 aa  117  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  38.17 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  38.17 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  35.29 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  38.17 
 
 		 198 aa  114  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.42 
 
 		 199 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  36.51 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.29 
 
 		 218 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  36.51 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  39.78 
 
 		 217 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  36.16 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  36.61 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  35.14 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  37.89 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  37.89 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  37.89 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  35.45 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  39.25 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  38.25 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  35.83 
 
 		 191 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002227  resolvase  49.17 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  37.91 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  36.26 
 
 		 183 aa  107  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  36.26 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  36.22 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  35.87 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  39.34 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  37.91 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  36.16 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  35.9 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  37.02 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  36.6 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  35.33 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  40.49 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  37.23 
 
 		 228 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>