More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1003 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 150 aa  299  7.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  68.75 
 
 		 147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  63.83 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  62.04 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  58.67 
 
 		 150 aa  178  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  57.72 
 
 		 150 aa  176  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.04 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.86 
 
 		 148 aa  172  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  58.57 
 
 		 149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.86 
 
 		 145 aa  170  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.75 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  46 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  55.48 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 		 146 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4497  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 149 aa  163  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81741  normal  0.381959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  47.33 
 
 		 159 aa  161  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.93 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.75 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 		 146 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.46 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0417  3-dehydroquinate dehydratase  54.42 
 
 		 149 aa  159  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.94 
 
 		 146 aa  159  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.27 
 
 		 184 aa  159  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.93 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 152 aa  158  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 		 150 aa  157  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3003  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216438  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.7 
 
 		 150 aa  157  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6025  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212804  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 153 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 149 aa  156  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  51.03 
 
 		 150 aa  157  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 153 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 145 aa  156  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 		 150 aa  156  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  51.01 
 
 		 157 aa  155  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  45.33 
 
 		 159 aa  155  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  45.33 
 
 		 159 aa  155  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3996  3-dehydroquinate dehydratase  51.35 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 145 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2690  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  44.67 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1559  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 148 aa  153  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0672163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 144 aa  153  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5818  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546847 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2097  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 		 145 aa  151  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 147 aa  151  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4434  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 145 aa  151  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433738 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 179 aa  150  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.37 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 162 aa  150  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.21 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 149 aa  150  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 145 aa  150  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  53.44 
 
 		 144 aa  149  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5767  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 145 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.533207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 146 aa  149  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  61.07 
 
 		 149 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 193 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5722  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 193 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.94 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 162 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 193 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 193 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  52.7 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>