More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2558 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 331 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  77.81 
 
 		 319 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  48.25 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  42.95 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  38.62 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  42.99 
 
 		 326 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  41.93 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  41.93 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  42.58 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  38.56 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  38.05 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  38.04 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  40.18 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  41.02 
 
 		 328 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  38.29 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  39.29 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  39.29 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  39.29 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  39.29 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  39.29 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  39.29 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  39.29 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  36.28 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  36.28 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  35.71 
 
 		 330 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 330 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 330 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  36.42 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  41.38 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  43.6 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  39.35 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  43.25 
 
 		 311 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  33.44 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  32.29 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  34.65 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  32.53 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  31.11 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  31.43 
 
 		 348 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  31.43 
 
 		 362 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  31.43 
 
 		 362 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  31.43 
 
 		 362 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  31.11 
 
 		 349 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  31.43 
 
 		 381 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  31.43 
 
 		 381 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  31.09 
 
 		 373 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  30.77 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  30.77 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  30.77 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  31.43 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  29.77 
 
 		 362 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  32.27 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  28.01 
 
 		 351 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  37.44 
 
 		 268 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  30.28 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  29.56 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  28.16 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  29.08 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  26.87 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.01 
 
 		 215 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  24.74 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  29.38 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  29.24 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  29.24 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  29.76 
 
 		 219 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  30.72 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  29.24 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  26.4 
 
 		 201 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  27.47 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  30.72 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  26.92 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  30.12 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  29.61 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  29.61 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  29.41 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  29.41 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  29.61 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  29.61 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  29.61 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  30.67 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  29.61 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.61 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  29.61 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  29.61 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  29.61 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  29.61 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  28.76 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  28.97 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  28.76 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  31.48 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  28.92 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  26.85 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  30.86 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.81 
 
 		 671 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.7 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  28.24 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  30.57 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  27.95 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.38 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  25.79 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>