More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0475 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 210 aa  433  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  97.13 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  97.13 
 
 		 210 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  48.02 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  48.48 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  47.5 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  47.98 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  47.06 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  46.57 
 
 		 206 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  43.14 
 
 		 207 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  44.12 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 206 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 208 aa  186  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  42.52 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 207 aa  184  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  45.05 
 
 		 207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  43.54 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  40.2 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  46.08 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  44.39 
 
 		 223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  42.93 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  42.93 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  42.29 
 
 		 208 aa  171  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  41.67 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  41.09 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  44.27 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  44.27 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  40.2 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0857  50S ribosomal protein L4  43.9 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  42.36 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  42 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  40.5 
 
 		 207 aa  164  8e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  39.11 
 
 		 205 aa  164  9e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  42.16 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  41.35 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0768  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000241518  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  37.56 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  42.44 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  41.35 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  40.89 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  39.42 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  37.75 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001741  LSU ribosomal protein L4p (L1e)  42.65 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000116803  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0478  ribosomal protein L4/L1e  41.5 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  38.64 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0961  50S ribosomal protein L4  43.68 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000392469  hitchhiker  0.00000164794 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0459  50S ribosomal protein L4  42.93 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03170  50S ribosomal protein L4  43.39 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000977912  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0394  ribosomal protein L4/L1e  43.39 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000162947  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3743  50S ribosomal protein L4  43.39 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.0176443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3635  50S ribosomal protein L4  43.39 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871014  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3708  50S ribosomal protein L4  43.39 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  0.838559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3806  50S ribosomal protein L4  43.39 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000172532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3635  50S ribosomal protein L4  43.39 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00226471  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3802  50S ribosomal protein L4  43.39 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3614  50S ribosomal protein L4  43.39 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000161283  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3513  50S ribosomal protein L4  43.39 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0394  50S ribosomal protein L4  43.39 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000249214  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4642  50S ribosomal protein L4  43.39 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120541  normal  0.0370586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3704  50S ribosomal protein L4  43.39 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112699  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03121  hypothetical protein  43.39 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000877437  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 205 aa  152  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4000  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 201 aa  151  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000185721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3821  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 201 aa  151  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000757079  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3750  50S ribosomal protein L4  43.39 
 
 		 201 aa  151  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000124791  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  41.71 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  42.08 
 
 		 207 aa  151  8e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  41.09 
 
 		 207 aa  151  8.999999999999999e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  37.9 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0324  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000187067  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0585  50S ribosomal protein L4  40.69 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000207865  normal  0.110437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0284  50S ribosomal protein L4  40.69 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000222015  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3914  50S ribosomal protein L4  40.69 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.05295e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0406  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00340494  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00731  50S ribosomal protein L4  42.16 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0455  50S ribosomal protein L4  42.41 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.035261  unclonable  0.000000191468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0485  50S ribosomal protein L4  42.41 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0488  50S ribosomal protein L4  42.41 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114619  normal  0.070368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4748  50S ribosomal protein L4  42.41 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000074471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  36.63 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  40.1 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4543  50S ribosomal protein L4  41.8 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000261898  hitchhiker  0.00202926 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0321  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 		 200 aa  148  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0789186  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0720  50S ribosomal protein L4  41.97 
 
 		 201 aa  148  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000427281  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1853  50S ribosomal protein L4  38.92 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000203721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>