More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3622 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 357 aa  671    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  65.24 
 
 		 199 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  64.2 
 
 		 222 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  57.22 
 
 		 205 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  64.02 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  63.64 
 
 		 204 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  63.25 
 
 		 227 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  62.2 
 
 		 351 aa  219  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  60.84 
 
 		 201 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  62.2 
 
 		 225 aa  217  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  60.37 
 
 		 243 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  53 
 
 		 233 aa  216  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  60.84 
 
 		 238 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  60.84 
 
 		 238 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  51.1 
 
 		 329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  60.24 
 
 		 243 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  60.84 
 
 		 238 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  60.49 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  59.76 
 
 		 415 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  59.64 
 
 		 196 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  53.11 
 
 		 401 aa  209  6e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  56.98 
 
 		 193 aa  209  7e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  61.78 
 
 		 182 aa  209  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  55.49 
 
 		 212 aa  206  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  62.42 
 
 		 179 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  58.54 
 
 		 182 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  57.32 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 198 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  56.79 
 
 		 197 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  57.32 
 
 		 356 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  57.41 
 
 		 207 aa  199  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  60.51 
 
 		 177 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  58.64 
 
 		 239 aa  199  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  47.96 
 
 		 238 aa  199  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  52.87 
 
 		 219 aa  199  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  53.63 
 
 		 225 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  58.55 
 
 		 195 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  58.02 
 
 		 204 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  60.26 
 
 		 168 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  58.33 
 
 		 175 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  56.17 
 
 		 187 aa  192  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  56.69 
 
 		 192 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  52.15 
 
 		 179 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  56.79 
 
 		 174 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  53.53 
 
 		 178 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 164 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 178 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  55.76 
 
 		 198 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  56.86 
 
 		 165 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  48.35 
 
 		 178 aa  186  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  52.07 
 
 		 184 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  50.28 
 
 		 182 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 173 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  47.75 
 
 		 249 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  48.6 
 
 		 202 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  50.88 
 
 		 252 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0830  translation initiation factor IF-3  49.71 
 
 		 176 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1728  initiation factor 3  56.88 
 
 		 149 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00351932  hitchhiker  0.00163995 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0802  translation initiation factor IF-3  49.71 
 
 		 176 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21910  translation initiation factor 3  54.88 
 
 		 208 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  51.79 
 
 		 190 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18251  translation initiation factor IF-3  49.21 
 
 		 195 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.412706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  54.61 
 
 		 154 aa  179  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18461  translation initiation factor IF-3  47.64 
 
 		 190 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  53.33 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18271  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 190 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.125602  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1729  translation initiation factor IF-3  46.6 
 
 		 190 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  52.9 
 
 		 156 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 171 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01551  translation initiation factor IF-3  45.12 
 
 		 219 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1215  translation initiation factor IF-3  48.42 
 
 		 202 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  56.12 
 
 		 145 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 202 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1509  translation initiation factor IF-3  56.38 
 
 		 204 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00441613  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3542  initiation factor 3  58.45 
 
 		 175 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.407448  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17631  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 202 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0131  translation initiation factor IF-3  45.9 
 
 		 217 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.122365  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0085  translation initiation factor IF-3  46.99 
 
 		 217 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  49.44 
 
 		 194 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 194 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  49.44 
 
 		 194 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  49.39 
 
 		 172 aa  173  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 173 aa  173  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20901  translation initiation factor IF-3  45.96 
 
 		 202 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.240556  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  51.97 
 
 		 181 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  48.21 
 
 		 177 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1823  translation initiation factor 3 (bIF-3)  51.33 
 
 		 153 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000272282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  48.52 
 
 		 179 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  48.1 
 
 		 173 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 		 170 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  48.8 
 
 		 173 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  50.88 
 
 		 176 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 		 172 aa  169  7e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  47.56 
 
 		 178 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  47.02 
 
 		 177 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  48.45 
 
 		 164 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1924  translation initiation factor IF-3  48.24 
 
 		 177 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 176 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  48.47 
 
 		 177 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  48.47 
 
 		 183 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>