More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2998 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  57.81 
 
 		 586 aa  673    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  60.66 
 
 		 588 aa  708    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  100 
 
 		 575 aa  1164    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  39.24 
 
 		 597 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  43.33 
 
 		 571 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.19 
 
 		 571 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  43.33 
 
 		 571 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.33 
 
 		 571 aa  435  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.33 
 
 		 571 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.14 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  43.14 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.14 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.14 
 
 		 571 aa  432  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  42.75 
 
 		 571 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  39.42 
 
 		 587 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  41.44 
 
 		 556 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  39.27 
 
 		 579 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 598 aa  418  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  38.97 
 
 		 602 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 620 aa  413  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  38.88 
 
 		 584 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  39.09 
 
 		 582 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  39.51 
 
 		 580 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  40.71 
 
 		 610 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  40.97 
 
 		 582 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  39.19 
 
 		 566 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  39.9 
 
 		 601 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 		 571 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  38.57 
 
 		 617 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  40.45 
 
 		 567 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  38.46 
 
 		 568 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.02 
 
 		 566 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  40.24 
 
 		 584 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  39.69 
 
 		 582 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  40.26 
 
 		 567 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  42.33 
 
 		 612 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  38.95 
 
 		 625 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  39.82 
 
 		 606 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  37.59 
 
 		 572 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  39.29 
 
 		 617 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  39.59 
 
 		 770 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  39.19 
 
 		 584 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  40.75 
 
 		 575 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  37.61 
 
 		 601 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  40.43 
 
 		 582 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.89 
 
 		 614 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  39.49 
 
 		 591 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.29 
 
 		 580 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  38.57 
 
 		 598 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  39.41 
 
 		 750 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  41.86 
 
 		 590 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  38.38 
 
 		 598 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.35 
 
 		 572 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  43.11 
 
 		 468 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 596 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  37.46 
 
 		 601 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  39.29 
 
 		 660 aa  392  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  36.49 
 
 		 579 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  37.11 
 
 		 572 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  37.39 
 
 		 601 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.77 
 
 		 580 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  38.18 
 
 		 598 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  38.11 
 
 		 582 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  37.24 
 
 		 601 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  37.13 
 
 		 595 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  39.93 
 
 		 590 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  42.59 
 
 		 578 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  39.33 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  41.21 
 
 		 608 aa  392  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.47 
 
 		 596 aa  387  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  38.86 
 
 		 644 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  37.94 
 
 		 575 aa  388  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  41.27 
 
 		 594 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  37 
 
 		 594 aa  385  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  40.04 
 
 		 658 aa  389  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  38.57 
 
 		 585 aa  386  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  40.65 
 
 		 590 aa  389  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  37.02 
 
 		 597 aa  385  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  37.85 
 
 		 600 aa  389  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  39.22 
 
 		 584 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  35.83 
 
 		 597 aa  385  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  41.86 
 
 		 764 aa  389  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  37.02 
 
 		 597 aa  385  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  41.81 
 
 		 641 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  38.24 
 
 		 572 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  36.93 
 
 		 578 aa  385  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  37.46 
 
 		 618 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  41.24 
 
 		 773 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  41.77 
 
 		 777 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.96 
 
 		 567 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.93 
 
 		 578 aa  385  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  37.85 
 
 		 597 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  38.79 
 
 		 666 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  41.19 
 
 		 620 aa  382  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  38.24 
 
 		 572 aa  382  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  38.54 
 
 		 768 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  38.02 
 
 		 615 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  37.63 
 
 		 726 aa  381  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  35.37 
 
 		 588 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  36.88 
 
 		 603 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>