More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2186 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  100 
 
 		 138 aa  286  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  67.13 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  55.71 
 
 		 134 aa  157  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  66.98 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  48 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3087  single-strand binding protein  48.76 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619635  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  56.86 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  46.04 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  42.25 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  46.94 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  54.55 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  45.83 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  54.55 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  43.15 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  53.64 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  53.64 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  53.64 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  53.64 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  42.75 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  53.64 
 
 		 170 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  53.64 
 
 		 169 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  53.64 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  53.64 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  52.73 
 
 		 164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  54.9 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  53.21 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  53.21 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  53.21 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  53.21 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  49.11 
 
 		 187 aa  110  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  45.97 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  51.85 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  48.74 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  44.76 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  38.46 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  41.13 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  50.46 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  49.53 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  48.04 
 
 		 148 aa  104  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  48.62 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  47.06 
 
 		 166 aa  103  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  44.95 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  50.47 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  48 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  48 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  44.04 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  49.04 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  38.46 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  39.44 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  47.83 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 188 aa  100  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  44.19 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  44.04 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  44.27 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  42.19 
 
 		 175 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 111 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  35.67 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  39.86 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  39.86 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  36.96 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  44.04 
 
 		 169 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  45.79 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  45.54 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  38.26 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  37.75 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 176 aa  94.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  37.59 
 
 		 138 aa  94.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 151 aa  94.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 156 aa  94.4  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  36.31 
 
 		 172 aa  94  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 111 aa  94  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  45.19 
 
 		 186 aa  93.6  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  42.48 
 
 		 165 aa  93.6  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  45.45 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  42.99 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  40.18 
 
 		 160 aa  93.2  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  42.11 
 
 		 192 aa  92.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  40.13 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  46.08 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  43.93 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  43.93 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  44.12 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  36.76 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  43.93 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  40.17 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  45.1 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  40.31 
 
 		 174 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  36.88 
 
 		 161 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 133 aa  90.1  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>