More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2656 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 168 aa  343  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  60.61 
 
 		 157 aa  200  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  68.7 
 
 		 164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  67.18 
 
 		 164 aa  194  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  58.78 
 
 		 164 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  65.32 
 
 		 168 aa  180  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  55.92 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00141  hypothetical protein  55.41 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  52.12 
 
 		 166 aa  178  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  61.54 
 
 		 202 aa  178  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  57.06 
 
 		 164 aa  177  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  51.48 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  54.32 
 
 		 168 aa  175  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 		 155 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  54.82 
 
 		 168 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  53.7 
 
 		 167 aa  174  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  54.55 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  62.1 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  62.1 
 
 		 198 aa  169  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  60.98 
 
 		 137 aa  167  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  52.38 
 
 		 169 aa  167  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  60.48 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  53.95 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  65.04 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  53.05 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  60.66 
 
 		 137 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  57.94 
 
 		 138 aa  163  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  60.9 
 
 		 138 aa  163  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  57.94 
 
 		 138 aa  163  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  46.34 
 
 		 164 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  50.92 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  59.38 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  52.05 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  57.78 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  57.78 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  50.61 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  60.63 
 
 		 171 aa  158  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  55.63 
 
 		 176 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  55.63 
 
 		 176 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  55.63 
 
 		 176 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  57.58 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  59.52 
 
 		 171 aa  157  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  47.31 
 
 		 164 aa  156  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  51.72 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  56.62 
 
 		 165 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1780  methionine-R-sulfoxide reductase  59.85 
 
 		 229 aa  155  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  48.73 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  58.09 
 
 		 165 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  57.58 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  46.43 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  47.46 
 
 		 174 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  59.69 
 
 		 136 aa  151  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 		 171 aa  151  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  51.53 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  54.81 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  54.33 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 161 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  54.4 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  56.1 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  57.03 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  44.24 
 
 		 167 aa  143  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  52.42 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  52.9 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  54.81 
 
 		 183 aa  141  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  52.8 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  51.45 
 
 		 180 aa  138  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  54.26 
 
 		 147 aa  137  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  55.56 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  50.72 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  50 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  54.55 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  55.28 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 		 136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0879  methionine-R-sulfoxide reductase  49.3 
 
 		 135 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.950161  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 		 142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 		 140 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 137 aa  130  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  51.97 
 
 		 151 aa  130  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 		 140 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  48.09 
 
 		 137 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  50.81 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  48.44 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  45.93 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  51.64 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 		 136 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  51.15 
 
 		 139 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  50.4 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  52.38 
 
 		 148 aa  127  8.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  46.46 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  50.82 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  49.22 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  47.97 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  49.22 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>