More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2637 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 493 aa  1018    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1191  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.82 
 
 		 489 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419241  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0559  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.31 
 
 		 508 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.6 
 
 		 494 aa  363  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3547  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.24 
 
 		 477 aa  334  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224357  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 470 aa  333  5e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4623  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.59 
 
 		 489 aa  324  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609617  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 478 aa  317  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.42 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2235  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.79 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7471  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 449 aa  294  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 480 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 521 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4822  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 496 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364543  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 492 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.66 
 
 		 487 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.61 
 
 		 482 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 470 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 470 aa  279  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2642  GntR family transcriptional regulator  34.79 
 
 		 496 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2148  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 498 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3187  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 487 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.685376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1025  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 499 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.684124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2755  putative transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.243959 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4437  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 469 aa  256  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2912  transcriptional regulator, GntR family  32.1 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.784119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 484 aa  236  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 503 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 490 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 491 aa  223  8e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.89 
 
 		 488 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  30.48 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 504 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.24 
 
 		 488 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 509 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 509 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 495 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 494 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  30.72 
 
 		 520 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 508 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 494 aa  203  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4617  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 480 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  31.35 
 
 		 509 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  32.3 
 
 		 509 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.61 
 
 		 499 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 517 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  30.14 
 
 		 520 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 488 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.18 
 
 		 495 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 493 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 489 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  30.04 
 
 		 493 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.74 
 
 		 490 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  30.37 
 
 		 570 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  30.37 
 
 		 493 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 504 aa  193  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 503 aa  192  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  28.6 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.3 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 503 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.52 
 
 		 485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 476 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.52 
 
 		 485 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  29.72 
 
 		 500 aa  190  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 478 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 503 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 493 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 473 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  28.9 
 
 		 496 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 504 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 496 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  29.11 
 
 		 502 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  29.19 
 
 		 508 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  28.54 
 
 		 475 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 574 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 490 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.93 
 
 		 496 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.1 
 
 		 494 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0611  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 559 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.361216  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0544  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 559 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1588  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 485 aa  182  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104897  hitchhiker  0.00377444 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0812  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 486 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.646381  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1329  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 559 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.401232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 501 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 496 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>